Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY3

PRUNE2, Protein prune homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRUNE2Q8WUY3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRUNE2Q8WUY3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRUNE2Q8WUY3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRUNE2Q8WUY3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRUNE2Q8WUY3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRUNE2Q8WUY3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRUNE2Q8WUY3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRUNE2Q8WUY3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRUNE2Q8WUY3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRUNE2Q8WUY3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRUNE2Q8WUY3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRUNE2Q8WUY3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRUNE2Q8WUY3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRUNE2Q8WUY3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PRUNE2Q8WUY3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRUNE2Q8WUY3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRUNE2Q8WUY3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRUNE2Q8WUY3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRUNE2Q8WUY3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRUNE2Q8WUY3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRUNE2Q8WUY3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRUNE2Q8WUY3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRUNE2Q8WUY3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRUNE2Q8WUY3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRUNE2Q8WUY3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRUNE2Q8WUY3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRUNE2Q8WUY3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRUNE2Q8WUY3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRUNE2Q8WUY3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRUNE2Q8WUY3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRUNE2Q8WUY3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PRUNE2Q8WUY3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRUNE2Q8WUY3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRUNE2Q8WUY3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRUNE2Q8WUY3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRUNE2Q8WUY3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PRUNE2Q8WUY3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRUNE2Q8WUY3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRUNE2Q8WUY3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRUNE2Q8WUY3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRUNE2Q8WUY3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRUNE2Q8WUY3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRUNE2Q8WUY3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PRUNE2Q8WUY3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRUNE2Q8WUY3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRUNE2Q8WUY3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRUNE2Q8WUY3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRUNE2Q8WUY3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRUNE2Q8WUY3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRUNE2Q8WUY3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRUNE2Q8WUY3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRUNE2Q8WUY3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRUNE2Q8WUY3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRUNE2Q8WUY3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRUNE2Q8WUY3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRUNE2Q8WUY3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRUNE2Q8WUY3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRUNE2Q8WUY3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRUNE2Q8WUY3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRUNE2Q8WUY3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRUNE2Q8WUY3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRUNE2Q8WUY3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRUNE2Q8WUY3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRUNE2Q8WUY3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRUNE2Q8WUY3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRUNE2Q8WUY3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRUNE2Q8WUY3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRUNE2Q8WUY3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRUNE2Q8WUY3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRUNE2Q8WUY3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRUNE2Q8WUY3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRUNE2Q8WUY3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRUNE2Q8WUY3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRUNE2Q8WUY3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRUNE2Q8WUY3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRUNE2Q8WUY3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRUNE2Q8WUY3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRUNE2Q8WUY3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PRUNE2Q8WUY3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRUNE2Q8WUY3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRUNE2Q8WUY3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRUNE2Q8WUY3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRUNE2Q8WUY3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRUNE2Q8WUY3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PRUNE2Q8WUY3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRUNE2Q8WUY3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PRUNE2Q8WUY3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRUNE2Q8WUY3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRUNE2Q8WUY3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRUNE2Q8WUY3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRUNE2Q8WUY3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRUNE2Q8WUY3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRUNE2Q8WUY3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRUNE2Q8WUY3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PRUNE2Q8WUY3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PRUNE2Q8WUY3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PRUNE2Q8WUY3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRUNE2Q8WUY3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRUNE2Q8WUY3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRUNE2Q8WUY3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms