Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU79

SMAP2, Stromal membrane-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAP2Q8WU79 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAP2Q8WU79 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAP2Q8WU79 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAP2Q8WU79 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAP2Q8WU79 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAP2Q8WU79 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAP2Q8WU79 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAP2Q8WU79 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAP2Q8WU79 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAP2Q8WU79 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAP2Q8WU79 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAP2Q8WU79 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAP2Q8WU79 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAP2Q8WU79 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAP2Q8WU79 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMAP2Q8WU79 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAP2Q8WU79 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAP2Q8WU79 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAP2Q8WU79 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAP2Q8WU79 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAP2Q8WU79 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAP2Q8WU79 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAP2Q8WU79 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAP2Q8WU79 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAP2Q8WU79 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAP2Q8WU79 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAP2Q8WU79 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAP2Q8WU79 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAP2Q8WU79 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAP2Q8WU79 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAP2Q8WU79 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAP2Q8WU79 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAP2Q8WU79 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAP2Q8WU79 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAP2Q8WU79 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAP2Q8WU79 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAP2Q8WU79 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAP2Q8WU79 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAP2Q8WU79 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAP2Q8WU79 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAP2Q8WU79 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMAP2Q8WU79 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAP2Q8WU79 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAP2Q8WU79 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAP2Q8WU79 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAP2Q8WU79 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAP2Q8WU79 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAP2Q8WU79 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAP2Q8WU79 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAP2Q8WU79 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAP2Q8WU79 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAP2Q8WU79 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAP2Q8WU79 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAP2Q8WU79 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAP2Q8WU79 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAP2Q8WU79 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAP2Q8WU79 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAP2Q8WU79 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAP2Q8WU79 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAP2Q8WU79 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAP2Q8WU79 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAP2Q8WU79 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAP2Q8WU79 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAP2Q8WU79 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAP2Q8WU79 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAP2Q8WU79 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAP2Q8WU79 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAP2Q8WU79 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAP2Q8WU79 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAP2Q8WU79 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAP2Q8WU79 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAP2Q8WU79 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAP2Q8WU79 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMAP2Q8WU79 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAP2Q8WU79 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAP2Q8WU79 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAP2Q8WU79 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAP2Q8WU79 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAP2Q8WU79 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAP2Q8WU79 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAP2Q8WU79 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAP2Q8WU79 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAP2Q8WU79 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAP2Q8WU79 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAP2Q8WU79 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAP2Q8WU79 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAP2Q8WU79 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAP2Q8WU79 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAP2Q8WU79 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAP2Q8WU79 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAP2Q8WU79 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAP2Q8WU79 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAP2Q8WU79 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAP2Q8WU79 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAP2Q8WU79 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAP2Q8WU79 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAP2Q8WU79 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAP2Q8WU79 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAP2Q8WU79 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAP2Q8WU79 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms