Protein–RNA interactions for Protein: Q8TER5

ARHGEF40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, humanhuman

Predictions only

Length 1,519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF40Q8TER5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ARHGEF40Q8TER5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
ARHGEF40Q8TER5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
ARHGEF40Q8TER5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
ARHGEF40Q8TER5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ARHGEF40Q8TER5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
ARHGEF40Q8TER5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
ARHGEF40Q8TER5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
ARHGEF40Q8TER5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
ARHGEF40Q8TER5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
ARHGEF40Q8TER5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
ARHGEF40Q8TER5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
ARHGEF40Q8TER5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
ARHGEF40Q8TER5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
ARHGEF40Q8TER5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
ARHGEF40Q8TER5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
ARHGEF40Q8TER5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
ARHGEF40Q8TER5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
ARHGEF40Q8TER5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ARHGEF40Q8TER5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
ARHGEF40Q8TER5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
ARHGEF40Q8TER5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
ARHGEF40Q8TER5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
ARHGEF40Q8TER5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ARHGEF40Q8TER5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
ARHGEF40Q8TER5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
ARHGEF40Q8TER5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
ARHGEF40Q8TER5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.27
ARHGEF40Q8TER5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.27
ARHGEF40Q8TER5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.69■■■■■ 4.27
ARHGEF40Q8TER5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
ARHGEF40Q8TER5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
ARHGEF40Q8TER5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
ARHGEF40Q8TER5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ARHGEF40Q8TER5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
ARHGEF40Q8TER5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
ARHGEF40Q8TER5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
ARHGEF40Q8TER5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
ARHGEF40Q8TER5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
ARHGEF40Q8TER5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
ARHGEF40Q8TER5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
ARHGEF40Q8TER5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
ARHGEF40Q8TER5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.62■■■■■ 4.25
ARHGEF40Q8TER5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
ARHGEF40Q8TER5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
ARHGEF40Q8TER5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
ARHGEF40Q8TER5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
ARHGEF40Q8TER5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
ARHGEF40Q8TER5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ARHGEF40Q8TER5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
ARHGEF40Q8TER5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
ARHGEF40Q8TER5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
ARHGEF40Q8TER5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
ARHGEF40Q8TER5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ARHGEF40Q8TER5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ARHGEF40Q8TER5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ARHGEF40Q8TER5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
ARHGEF40Q8TER5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
ARHGEF40Q8TER5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
ARHGEF40Q8TER5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ARHGEF40Q8TER5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ARHGEF40Q8TER5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ARHGEF40Q8TER5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ARHGEF40Q8TER5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.38■■■■■ 4.21
ARHGEF40Q8TER5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ARHGEF40Q8TER5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
ARHGEF40Q8TER5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
ARHGEF40Q8TER5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
ARHGEF40Q8TER5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
ARHGEF40Q8TER5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
ARHGEF40Q8TER5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARHGEF40Q8TER5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARHGEF40Q8TER5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ARHGEF40Q8TER5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ARHGEF40Q8TER5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
ARHGEF40Q8TER5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
ARHGEF40Q8TER5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
ARHGEF40Q8TER5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
ARHGEF40Q8TER5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
ARHGEF40Q8TER5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ARHGEF40Q8TER5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
ARHGEF40Q8TER5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARHGEF40Q8TER5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARHGEF40Q8TER5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARHGEF40Q8TER5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
ARHGEF40Q8TER5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
ARHGEF40Q8TER5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ARHGEF40Q8TER5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARHGEF40Q8TER5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARHGEF40Q8TER5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARHGEF40Q8TER5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARHGEF40Q8TER5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARHGEF40Q8TER5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARHGEF40Q8TER5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARHGEF40Q8TER5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGEF40Q8TER5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGEF40Q8TER5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGEF40Q8TER5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ARHGEF40Q8TER5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ARHGEF40Q8TER5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
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