Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACTRT2Q8TDY3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTRT2Q8TDY3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTRT2Q8TDY3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTRT2Q8TDY3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACTRT2Q8TDY3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACTRT2Q8TDY3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACTRT2Q8TDY3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTRT2Q8TDY3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTRT2Q8TDY3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTRT2Q8TDY3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACTRT2Q8TDY3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTRT2Q8TDY3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTRT2Q8TDY3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTRT2Q8TDY3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTRT2Q8TDY3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTRT2Q8TDY3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTRT2Q8TDY3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTRT2Q8TDY3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTRT2Q8TDY3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTRT2Q8TDY3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTRT2Q8TDY3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTRT2Q8TDY3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTRT2Q8TDY3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTRT2Q8TDY3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTRT2Q8TDY3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTRT2Q8TDY3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTRT2Q8TDY3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTRT2Q8TDY3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTRT2Q8TDY3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTRT2Q8TDY3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTRT2Q8TDY3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTRT2Q8TDY3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTRT2Q8TDY3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTRT2Q8TDY3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTRT2Q8TDY3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTRT2Q8TDY3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTRT2Q8TDY3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTRT2Q8TDY3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTRT2Q8TDY3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTRT2Q8TDY3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTRT2Q8TDY3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTRT2Q8TDY3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTRT2Q8TDY3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTRT2Q8TDY3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTRT2Q8TDY3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTRT2Q8TDY3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ACTRT2Q8TDY3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTRT2Q8TDY3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTRT2Q8TDY3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTRT2Q8TDY3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTRT2Q8TDY3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTRT2Q8TDY3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTRT2Q8TDY3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTRT2Q8TDY3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTRT2Q8TDY3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTRT2Q8TDY3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTRT2Q8TDY3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTRT2Q8TDY3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTRT2Q8TDY3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ACTRT2Q8TDY3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ACTRT2Q8TDY3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTRT2Q8TDY3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTRT2Q8TDY3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTRT2Q8TDY3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTRT2Q8TDY3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTRT2Q8TDY3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTRT2Q8TDY3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTRT2Q8TDY3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTRT2Q8TDY3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTRT2Q8TDY3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTRT2Q8TDY3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTRT2Q8TDY3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTRT2Q8TDY3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTRT2Q8TDY3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTRT2Q8TDY3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ACTRT2Q8TDY3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTRT2Q8TDY3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTRT2Q8TDY3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTRT2Q8TDY3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTRT2Q8TDY3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTRT2Q8TDY3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTRT2Q8TDY3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTRT2Q8TDY3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTRT2Q8TDY3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACTRT2Q8TDY3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTRT2Q8TDY3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTRT2Q8TDY3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTRT2Q8TDY3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTRT2Q8TDY3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTRT2Q8TDY3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTRT2Q8TDY3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTRT2Q8TDY3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTRT2Q8TDY3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTRT2Q8TDY3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTRT2Q8TDY3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTRT2Q8TDY3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTRT2Q8TDY3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTRT2Q8TDY3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTRT2Q8TDY3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms