Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLGN4YQ8NFZ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NLGN4YQ8NFZ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLGN4YQ8NFZ3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLGN4YQ8NFZ3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NLGN4YQ8NFZ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLGN4YQ8NFZ3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLGN4YQ8NFZ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLGN4YQ8NFZ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLGN4YQ8NFZ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLGN4YQ8NFZ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLGN4YQ8NFZ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLGN4YQ8NFZ3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLGN4YQ8NFZ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLGN4YQ8NFZ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NLGN4YQ8NFZ3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLGN4YQ8NFZ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLGN4YQ8NFZ3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLGN4YQ8NFZ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NLGN4YQ8NFZ3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLGN4YQ8NFZ3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLGN4YQ8NFZ3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLGN4YQ8NFZ3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLGN4YQ8NFZ3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLGN4YQ8NFZ3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLGN4YQ8NFZ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLGN4YQ8NFZ3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLGN4YQ8NFZ3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLGN4YQ8NFZ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLGN4YQ8NFZ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLGN4YQ8NFZ3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLGN4YQ8NFZ3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLGN4YQ8NFZ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLGN4YQ8NFZ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLGN4YQ8NFZ3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLGN4YQ8NFZ3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLGN4YQ8NFZ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLGN4YQ8NFZ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLGN4YQ8NFZ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLGN4YQ8NFZ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLGN4YQ8NFZ3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLGN4YQ8NFZ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLGN4YQ8NFZ3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLGN4YQ8NFZ3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLGN4YQ8NFZ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLGN4YQ8NFZ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLGN4YQ8NFZ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLGN4YQ8NFZ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLGN4YQ8NFZ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLGN4YQ8NFZ3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLGN4YQ8NFZ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLGN4YQ8NFZ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLGN4YQ8NFZ3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NLGN4YQ8NFZ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NLGN4YQ8NFZ3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLGN4YQ8NFZ3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLGN4YQ8NFZ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLGN4YQ8NFZ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLGN4YQ8NFZ3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLGN4YQ8NFZ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLGN4YQ8NFZ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLGN4YQ8NFZ3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLGN4YQ8NFZ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLGN4YQ8NFZ3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLGN4YQ8NFZ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLGN4YQ8NFZ3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLGN4YQ8NFZ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLGN4YQ8NFZ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLGN4YQ8NFZ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLGN4YQ8NFZ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms