Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSBQ8NFR3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPTSSBQ8NFR3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTSSBQ8NFR3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPTSSBQ8NFR3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSBQ8NFR3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSBQ8NFR3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSBQ8NFR3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTSSBQ8NFR3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTSSBQ8NFR3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSBQ8NFR3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSBQ8NFR3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSBQ8NFR3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSBQ8NFR3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSBQ8NFR3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSBQ8NFR3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSBQ8NFR3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSBQ8NFR3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSBQ8NFR3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTSSBQ8NFR3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSBQ8NFR3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSBQ8NFR3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTSSBQ8NFR3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTSSBQ8NFR3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSBQ8NFR3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSBQ8NFR3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSBQ8NFR3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSBQ8NFR3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSBQ8NFR3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSBQ8NFR3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSBQ8NFR3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSBQ8NFR3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSBQ8NFR3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSBQ8NFR3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSBQ8NFR3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSBQ8NFR3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSBQ8NFR3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSBQ8NFR3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTSSBQ8NFR3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTSSBQ8NFR3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPTSSBQ8NFR3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPTSSBQ8NFR3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPTSSBQ8NFR3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSBQ8NFR3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSBQ8NFR3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSBQ8NFR3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPTSSBQ8NFR3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSBQ8NFR3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSBQ8NFR3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPTSSBQ8NFR3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTSSBQ8NFR3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPTSSBQ8NFR3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSBQ8NFR3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSBQ8NFR3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTSSBQ8NFR3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTSSBQ8NFR3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSBQ8NFR3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSBQ8NFR3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTSSBQ8NFR3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSBQ8NFR3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSBQ8NFR3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTSSBQ8NFR3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms