Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHE23Q8NDY6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHE23Q8NDY6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHE23Q8NDY6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHE23Q8NDY6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHE23Q8NDY6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHE23Q8NDY6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHE23Q8NDY6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHE23Q8NDY6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHE23Q8NDY6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHLHE23Q8NDY6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHE23Q8NDY6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHE23Q8NDY6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHE23Q8NDY6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHE23Q8NDY6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHE23Q8NDY6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHE23Q8NDY6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHE23Q8NDY6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BHLHE23Q8NDY6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHE23Q8NDY6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHE23Q8NDY6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHLHE23Q8NDY6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHLHE23Q8NDY6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHLHE23Q8NDY6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHLHE23Q8NDY6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHLHE23Q8NDY6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BHLHE23Q8NDY6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHLHE23Q8NDY6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHLHE23Q8NDY6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHE23Q8NDY6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHE23Q8NDY6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHLHE23Q8NDY6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHLHE23Q8NDY6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHLHE23Q8NDY6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHLHE23Q8NDY6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHLHE23Q8NDY6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHLHE23Q8NDY6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHLHE23Q8NDY6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHLHE23Q8NDY6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHLHE23Q8NDY6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHLHE23Q8NDY6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHLHE23Q8NDY6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHLHE23Q8NDY6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHLHE23Q8NDY6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHLHE23Q8NDY6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHLHE23Q8NDY6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BHLHE23Q8NDY6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHE23Q8NDY6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHE23Q8NDY6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHLHE23Q8NDY6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHLHE23Q8NDY6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHLHE23Q8NDY6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHLHE23Q8NDY6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHE23Q8NDY6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHE23Q8NDY6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BHLHE23Q8NDY6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHE23Q8NDY6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHE23Q8NDY6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHE23Q8NDY6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHE23Q8NDY6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHE23Q8NDY6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHE23Q8NDY6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHLHE23Q8NDY6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHLHE23Q8NDY6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHLHE23Q8NDY6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHLHE23Q8NDY6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHE23Q8NDY6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE23Q8NDY6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.7 ms