Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD1Q8NB12 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD1Q8NB12 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMYD1Q8NB12 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMYD1Q8NB12 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMYD1Q8NB12 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMYD1Q8NB12 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMYD1Q8NB12 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMYD1Q8NB12 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMYD1Q8NB12 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMYD1Q8NB12 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD1Q8NB12 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMYD1Q8NB12 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMYD1Q8NB12 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD1Q8NB12 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD1Q8NB12 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD1Q8NB12 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMYD1Q8NB12 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD1Q8NB12 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD1Q8NB12 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMYD1Q8NB12 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMYD1Q8NB12 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMYD1Q8NB12 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD1Q8NB12 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD1Q8NB12 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD1Q8NB12 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD1Q8NB12 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD1Q8NB12 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD1Q8NB12 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD1Q8NB12 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD1Q8NB12 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD1Q8NB12 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD1Q8NB12 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD1Q8NB12 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD1Q8NB12 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD1Q8NB12 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD1Q8NB12 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD1Q8NB12 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD1Q8NB12 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD1Q8NB12 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD1Q8NB12 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD1Q8NB12 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD1Q8NB12 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD1Q8NB12 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD1Q8NB12 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD1Q8NB12 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD1Q8NB12 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD1Q8NB12 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD1Q8NB12 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD1Q8NB12 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD1Q8NB12 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD1Q8NB12 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD1Q8NB12 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD1Q8NB12 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD1Q8NB12 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMYD1Q8NB12 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMYD1Q8NB12 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD1Q8NB12 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD1Q8NB12 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD1Q8NB12 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD1Q8NB12 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD1Q8NB12 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD1Q8NB12 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD1Q8NB12 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD1Q8NB12 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD1Q8NB12 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD1Q8NB12 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD1Q8NB12 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD1Q8NB12 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD1Q8NB12 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD1Q8NB12 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD1Q8NB12 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD1Q8NB12 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD1Q8NB12 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD1Q8NB12 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMYD1Q8NB12 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMYD1Q8NB12 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMYD1Q8NB12 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD1Q8NB12 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD1Q8NB12 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD1Q8NB12 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD1Q8NB12 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD1Q8NB12 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD1Q8NB12 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD1Q8NB12 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD1Q8NB12 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD1Q8NB12 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD1Q8NB12 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD1Q8NB12 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD1Q8NB12 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD1Q8NB12 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD1Q8NB12 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMYD1Q8NB12 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMYD1Q8NB12 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMYD1Q8NB12 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMYD1Q8NB12 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMYD1Q8NB12 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMYD1Q8NB12 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMYD1Q8NB12 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMYD1Q8NB12 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms