Protein–RNA interactions for Protein: Q8N988

ZNF557, Zinc finger protein 557, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF557Q8N988 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF557Q8N988 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF557Q8N988 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF557Q8N988 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF557Q8N988 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF557Q8N988 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF557Q8N988 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF557Q8N988 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF557Q8N988 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF557Q8N988 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF557Q8N988 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF557Q8N988 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF557Q8N988 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF557Q8N988 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF557Q8N988 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF557Q8N988 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF557Q8N988 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF557Q8N988 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF557Q8N988 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF557Q8N988 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF557Q8N988 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF557Q8N988 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF557Q8N988 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF557Q8N988 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF557Q8N988 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF557Q8N988 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF557Q8N988 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF557Q8N988 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF557Q8N988 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF557Q8N988 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF557Q8N988 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF557Q8N988 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF557Q8N988 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF557Q8N988 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF557Q8N988 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF557Q8N988 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF557Q8N988 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF557Q8N988 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF557Q8N988 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF557Q8N988 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF557Q8N988 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF557Q8N988 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF557Q8N988 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF557Q8N988 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF557Q8N988 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF557Q8N988 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF557Q8N988 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF557Q8N988 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF557Q8N988 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF557Q8N988 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF557Q8N988 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ZNF557Q8N988 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF557Q8N988 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF557Q8N988 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF557Q8N988 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF557Q8N988 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF557Q8N988 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF557Q8N988 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF557Q8N988 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF557Q8N988 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF557Q8N988 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF557Q8N988 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF557Q8N988 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF557Q8N988 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF557Q8N988 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF557Q8N988 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF557Q8N988 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF557Q8N988 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF557Q8N988 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF557Q8N988 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF557Q8N988 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF557Q8N988 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF557Q8N988 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF557Q8N988 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF557Q8N988 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF557Q8N988 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF557Q8N988 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF557Q8N988 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF557Q8N988 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF557Q8N988 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF557Q8N988 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF557Q8N988 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF557Q8N988 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms