Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTD1Q8N815 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTD1Q8N815 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTD1Q8N815 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTD1Q8N815 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNTD1Q8N815 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNTD1Q8N815 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTD1Q8N815 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTD1Q8N815 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTD1Q8N815 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTD1Q8N815 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTD1Q8N815 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTD1Q8N815 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTD1Q8N815 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTD1Q8N815 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTD1Q8N815 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNTD1Q8N815 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTD1Q8N815 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTD1Q8N815 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTD1Q8N815 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTD1Q8N815 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTD1Q8N815 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTD1Q8N815 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CNTD1Q8N815 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTD1Q8N815 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTD1Q8N815 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTD1Q8N815 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNTD1Q8N815 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CNTD1Q8N815 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNTD1Q8N815 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CNTD1Q8N815 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNTD1Q8N815 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTD1Q8N815 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTD1Q8N815 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTD1Q8N815 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTD1Q8N815 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTD1Q8N815 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTD1Q8N815 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTD1Q8N815 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTD1Q8N815 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTD1Q8N815 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTD1Q8N815 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTD1Q8N815 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTD1Q8N815 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTD1Q8N815 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTD1Q8N815 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTD1Q8N815 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTD1Q8N815 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTD1Q8N815 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTD1Q8N815 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTD1Q8N815 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTD1Q8N815 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTD1Q8N815 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTD1Q8N815 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTD1Q8N815 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTD1Q8N815 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTD1Q8N815 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTD1Q8N815 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTD1Q8N815 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTD1Q8N815 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTD1Q8N815 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTD1Q8N815 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTD1Q8N815 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTD1Q8N815 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTD1Q8N815 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTD1Q8N815 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTD1Q8N815 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTD1Q8N815 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTD1Q8N815 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTD1Q8N815 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTD1Q8N815 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTD1Q8N815 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTD1Q8N815 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTD1Q8N815 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTD1Q8N815 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTD1Q8N815 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTD1Q8N815 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTD1Q8N815 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTD1Q8N815 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTD1Q8N815 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms