Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN19Q8N6F1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN19Q8N6F1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLDN19Q8N6F1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLDN19Q8N6F1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN19Q8N6F1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN19Q8N6F1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN19Q8N6F1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN19Q8N6F1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN19Q8N6F1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN19Q8N6F1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN19Q8N6F1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN19Q8N6F1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN19Q8N6F1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN19Q8N6F1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN19Q8N6F1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN19Q8N6F1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN19Q8N6F1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN19Q8N6F1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN19Q8N6F1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN19Q8N6F1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN19Q8N6F1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLDN19Q8N6F1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLDN19Q8N6F1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLDN19Q8N6F1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN19Q8N6F1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN19Q8N6F1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN19Q8N6F1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN19Q8N6F1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN19Q8N6F1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN19Q8N6F1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN19Q8N6F1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN19Q8N6F1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN19Q8N6F1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN19Q8N6F1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN19Q8N6F1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN19Q8N6F1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN19Q8N6F1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN19Q8N6F1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDN19Q8N6F1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLDN19Q8N6F1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDN19Q8N6F1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDN19Q8N6F1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDN19Q8N6F1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDN19Q8N6F1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDN19Q8N6F1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLDN19Q8N6F1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLDN19Q8N6F1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLDN19Q8N6F1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDN19Q8N6F1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDN19Q8N6F1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN19Q8N6F1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN19Q8N6F1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN19Q8N6F1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDN19Q8N6F1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDN19Q8N6F1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN19Q8N6F1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN19Q8N6F1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN19Q8N6F1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN19Q8N6F1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN19Q8N6F1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLDN19Q8N6F1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLDN19Q8N6F1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLDN19Q8N6F1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLDN19Q8N6F1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN19Q8N6F1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN19Q8N6F1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN19Q8N6F1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN19Q8N6F1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN19Q8N6F1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN19Q8N6F1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN19Q8N6F1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN19Q8N6F1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN19Q8N6F1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN19Q8N6F1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN19Q8N6F1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN19Q8N6F1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN19Q8N6F1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN19Q8N6F1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN19Q8N6F1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN19Q8N6F1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN19Q8N6F1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN19Q8N6F1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
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