Protein–RNA interactions for Protein: Q8N370

SLC43A2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A2Q8N370 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC43A2Q8N370 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC43A2Q8N370 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC43A2Q8N370 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC43A2Q8N370 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC43A2Q8N370 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC43A2Q8N370 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC43A2Q8N370 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC43A2Q8N370 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC43A2Q8N370 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC43A2Q8N370 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC43A2Q8N370 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC43A2Q8N370 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC43A2Q8N370 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC43A2Q8N370 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC43A2Q8N370 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC43A2Q8N370 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC43A2Q8N370 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC43A2Q8N370 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC43A2Q8N370 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC43A2Q8N370 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC43A2Q8N370 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC43A2Q8N370 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC43A2Q8N370 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC43A2Q8N370 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC43A2Q8N370 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC43A2Q8N370 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC43A2Q8N370 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC43A2Q8N370 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC43A2Q8N370 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC43A2Q8N370 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC43A2Q8N370 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC43A2Q8N370 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC43A2Q8N370 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC43A2Q8N370 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC43A2Q8N370 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC43A2Q8N370 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC43A2Q8N370 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC43A2Q8N370 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC43A2Q8N370 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC43A2Q8N370 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC43A2Q8N370 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC43A2Q8N370 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC43A2Q8N370 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC43A2Q8N370 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC43A2Q8N370 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC43A2Q8N370 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC43A2Q8N370 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC43A2Q8N370 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC43A2Q8N370 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC43A2Q8N370 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC43A2Q8N370 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC43A2Q8N370 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC43A2Q8N370 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC43A2Q8N370 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC43A2Q8N370 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC43A2Q8N370 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC43A2Q8N370 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC43A2Q8N370 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC43A2Q8N370 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC43A2Q8N370 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC43A2Q8N370 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC43A2Q8N370 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC43A2Q8N370 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC43A2Q8N370 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC43A2Q8N370 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC43A2Q8N370 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC43A2Q8N370 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC43A2Q8N370 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC43A2Q8N370 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC43A2Q8N370 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC43A2Q8N370 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC43A2Q8N370 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC43A2Q8N370 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms