Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GPC2Q8N158 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GPC2Q8N158 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GPC2Q8N158 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GPC2Q8N158 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GPC2Q8N158 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GPC2Q8N158 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GPC2Q8N158 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
GPC2Q8N158 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GPC2Q8N158 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GPC2Q8N158 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GPC2Q8N158 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GPC2Q8N158 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GPC2Q8N158 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GPC2Q8N158 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GPC2Q8N158 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
GPC2Q8N158 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GPC2Q8N158 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GPC2Q8N158 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GPC2Q8N158 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GPC2Q8N158 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GPC2Q8N158 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
GPC2Q8N158 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GPC2Q8N158 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
GPC2Q8N158 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GPC2Q8N158 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GPC2Q8N158 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GPC2Q8N158 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GPC2Q8N158 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
GPC2Q8N158 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GPC2Q8N158 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GPC2Q8N158 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GPC2Q8N158 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GPC2Q8N158 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
GPC2Q8N158 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GPC2Q8N158 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GPC2Q8N158 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GPC2Q8N158 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GPC2Q8N158 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GPC2Q8N158 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GPC2Q8N158 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GPC2Q8N158 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GPC2Q8N158 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GPC2Q8N158 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GPC2Q8N158 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GPC2Q8N158 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GPC2Q8N158 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GPC2Q8N158 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GPC2Q8N158 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GPC2Q8N158 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GPC2Q8N158 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GPC2Q8N158 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
GPC2Q8N158 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GPC2Q8N158 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
GPC2Q8N158 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
GPC2Q8N158 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GPC2Q8N158 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GPC2Q8N158 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GPC2Q8N158 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GPC2Q8N158 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
GPC2Q8N158 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GPC2Q8N158 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GPC2Q8N158 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GPC2Q8N158 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GPC2Q8N158 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GPC2Q8N158 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GPC2Q8N158 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GPC2Q8N158 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GPC2Q8N158 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GPC2Q8N158 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GPC2Q8N158 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GPC2Q8N158 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GPC2Q8N158 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GPC2Q8N158 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GPC2Q8N158 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GPC2Q8N158 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GPC2Q8N158 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GPC2Q8N158 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GPC2Q8N158 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
GPC2Q8N158 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33■■■□□ 2.87
GPC2Q8N158 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
GPC2Q8N158 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GPC2Q8N158 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
GPC2Q8N158 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GPC2Q8N158 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GPC2Q8N158 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
GPC2Q8N158 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
GPC2Q8N158 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
GPC2Q8N158 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GPC2Q8N158 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
GPC2Q8N158 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
GPC2Q8N158 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GPC2Q8N158 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GPC2Q8N158 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GPC2Q8N158 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GPC2Q8N158 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GPC2Q8N158 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GPC2Q8N158 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GPC2Q8N158 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GPC2Q8N158 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms