Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZF0

NALCN, Sodium leak channel non-selective protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NALCNQ8IZF0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NALCNQ8IZF0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NALCNQ8IZF0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NALCNQ8IZF0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
NALCNQ8IZF0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NALCNQ8IZF0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NALCNQ8IZF0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NALCNQ8IZF0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NALCNQ8IZF0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NALCNQ8IZF0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NALCNQ8IZF0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NALCNQ8IZF0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
NALCNQ8IZF0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NALCNQ8IZF0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NALCNQ8IZF0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NALCNQ8IZF0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NALCNQ8IZF0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NALCNQ8IZF0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NALCNQ8IZF0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
NALCNQ8IZF0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
NALCNQ8IZF0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
NALCNQ8IZF0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NALCNQ8IZF0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
NALCNQ8IZF0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
NALCNQ8IZF0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
NALCNQ8IZF0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
NALCNQ8IZF0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
NALCNQ8IZF0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NALCNQ8IZF0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NALCNQ8IZF0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NALCNQ8IZF0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NALCNQ8IZF0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NALCNQ8IZF0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NALCNQ8IZF0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NALCNQ8IZF0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NALCNQ8IZF0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NALCNQ8IZF0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NALCNQ8IZF0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NALCNQ8IZF0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
NALCNQ8IZF0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
NALCNQ8IZF0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
NALCNQ8IZF0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
NALCNQ8IZF0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
NALCNQ8IZF0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NALCNQ8IZF0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NALCNQ8IZF0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NALCNQ8IZF0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NALCNQ8IZF0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NALCNQ8IZF0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
NALCNQ8IZF0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
NALCNQ8IZF0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NALCNQ8IZF0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
NALCNQ8IZF0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NALCNQ8IZF0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NALCNQ8IZF0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NALCNQ8IZF0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NALCNQ8IZF0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NALCNQ8IZF0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NALCNQ8IZF0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NALCNQ8IZF0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
NALCNQ8IZF0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
NALCNQ8IZF0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NALCNQ8IZF0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NALCNQ8IZF0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NALCNQ8IZF0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NALCNQ8IZF0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NALCNQ8IZF0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NALCNQ8IZF0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NALCNQ8IZF0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NALCNQ8IZF0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NALCNQ8IZF0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NALCNQ8IZF0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NALCNQ8IZF0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
NALCNQ8IZF0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NALCNQ8IZF0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
NALCNQ8IZF0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NALCNQ8IZF0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NALCNQ8IZF0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
NALCNQ8IZF0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NALCNQ8IZF0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
NALCNQ8IZF0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
NALCNQ8IZF0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
NALCNQ8IZF0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NALCNQ8IZF0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NALCNQ8IZF0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NALCNQ8IZF0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NALCNQ8IZF0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NALCNQ8IZF0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NALCNQ8IZF0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
NALCNQ8IZF0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
NALCNQ8IZF0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
NALCNQ8IZF0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NALCNQ8IZF0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
NALCNQ8IZF0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NALCNQ8IZF0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NALCNQ8IZF0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NALCNQ8IZF0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NALCNQ8IZF0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NALCNQ8IZF0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NALCNQ8IZF0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms