Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZC4

RTKN2, Rhotekin-2, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN2Q8IZC4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RTKN2Q8IZC4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RTKN2Q8IZC4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RTKN2Q8IZC4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RTKN2Q8IZC4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RTKN2Q8IZC4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RTKN2Q8IZC4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RTKN2Q8IZC4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RTKN2Q8IZC4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RTKN2Q8IZC4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RTKN2Q8IZC4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RTKN2Q8IZC4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RTKN2Q8IZC4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTKN2Q8IZC4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTKN2Q8IZC4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTKN2Q8IZC4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTKN2Q8IZC4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTKN2Q8IZC4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RTKN2Q8IZC4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RTKN2Q8IZC4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RTKN2Q8IZC4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RTKN2Q8IZC4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RTKN2Q8IZC4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RTKN2Q8IZC4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
RTKN2Q8IZC4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.8■■■■□ 3
RTKN2Q8IZC4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RTKN2Q8IZC4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RTKN2Q8IZC4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RTKN2Q8IZC4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RTKN2Q8IZC4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RTKN2Q8IZC4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RTKN2Q8IZC4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RTKN2Q8IZC4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RTKN2Q8IZC4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RTKN2Q8IZC4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RTKN2Q8IZC4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RTKN2Q8IZC4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RTKN2Q8IZC4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
RTKN2Q8IZC4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RTKN2Q8IZC4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RTKN2Q8IZC4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RTKN2Q8IZC4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RTKN2Q8IZC4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RTKN2Q8IZC4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RTKN2Q8IZC4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RTKN2Q8IZC4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RTKN2Q8IZC4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RTKN2Q8IZC4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RTKN2Q8IZC4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RTKN2Q8IZC4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
RTKN2Q8IZC4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RTKN2Q8IZC4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RTKN2Q8IZC4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RTKN2Q8IZC4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RTKN2Q8IZC4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RTKN2Q8IZC4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RTKN2Q8IZC4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RTKN2Q8IZC4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RTKN2Q8IZC4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RTKN2Q8IZC4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RTKN2Q8IZC4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RTKN2Q8IZC4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RTKN2Q8IZC4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RTKN2Q8IZC4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RTKN2Q8IZC4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RTKN2Q8IZC4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RTKN2Q8IZC4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RTKN2Q8IZC4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RTKN2Q8IZC4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
RTKN2Q8IZC4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
RTKN2Q8IZC4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
RTKN2Q8IZC4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
RTKN2Q8IZC4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RTKN2Q8IZC4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RTKN2Q8IZC4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
RTKN2Q8IZC4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RTKN2Q8IZC4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RTKN2Q8IZC4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RTKN2Q8IZC4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RTKN2Q8IZC4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RTKN2Q8IZC4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RTKN2Q8IZC4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RTKN2Q8IZC4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RTKN2Q8IZC4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RTKN2Q8IZC4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RTKN2Q8IZC4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
RTKN2Q8IZC4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RTKN2Q8IZC4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RTKN2Q8IZC4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RTKN2Q8IZC4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RTKN2Q8IZC4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RTKN2Q8IZC4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RTKN2Q8IZC4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RTKN2Q8IZC4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
RTKN2Q8IZC4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RTKN2Q8IZC4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RTKN2Q8IZC4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RTKN2Q8IZC4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RTKN2Q8IZC4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
RTKN2Q8IZC4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms