Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZA3

H1FOO, Histone H1oo, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1FOOQ8IZA3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H1FOOQ8IZA3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H1FOOQ8IZA3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H1FOOQ8IZA3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H1FOOQ8IZA3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H1FOOQ8IZA3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H1FOOQ8IZA3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H1FOOQ8IZA3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H1FOOQ8IZA3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H1FOOQ8IZA3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H1FOOQ8IZA3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H1FOOQ8IZA3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H1FOOQ8IZA3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H1FOOQ8IZA3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H1FOOQ8IZA3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H1FOOQ8IZA3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H1FOOQ8IZA3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
H1FOOQ8IZA3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H1FOOQ8IZA3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H1FOOQ8IZA3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H1FOOQ8IZA3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H1FOOQ8IZA3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H1FOOQ8IZA3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H1FOOQ8IZA3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H1FOOQ8IZA3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H1FOOQ8IZA3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H1FOOQ8IZA3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H1FOOQ8IZA3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H1FOOQ8IZA3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H1FOOQ8IZA3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H1FOOQ8IZA3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H1FOOQ8IZA3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H1FOOQ8IZA3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H1FOOQ8IZA3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H1FOOQ8IZA3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H1FOOQ8IZA3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H1FOOQ8IZA3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H1FOOQ8IZA3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H1FOOQ8IZA3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H1FOOQ8IZA3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H1FOOQ8IZA3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H1FOOQ8IZA3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H1FOOQ8IZA3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H1FOOQ8IZA3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H1FOOQ8IZA3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H1FOOQ8IZA3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H1FOOQ8IZA3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H1FOOQ8IZA3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H1FOOQ8IZA3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H1FOOQ8IZA3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H1FOOQ8IZA3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H1FOOQ8IZA3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H1FOOQ8IZA3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H1FOOQ8IZA3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H1FOOQ8IZA3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H1FOOQ8IZA3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms