Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APLFQ8IW19 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APLFQ8IW19 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APLFQ8IW19 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APLFQ8IW19 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APLFQ8IW19 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APLFQ8IW19 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APLFQ8IW19 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APLFQ8IW19 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APLFQ8IW19 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APLFQ8IW19 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APLFQ8IW19 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APLFQ8IW19 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
APLFQ8IW19 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APLFQ8IW19 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APLFQ8IW19 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APLFQ8IW19 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APLFQ8IW19 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APLFQ8IW19 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APLFQ8IW19 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APLFQ8IW19 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APLFQ8IW19 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APLFQ8IW19 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APLFQ8IW19 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APLFQ8IW19 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APLFQ8IW19 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APLFQ8IW19 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APLFQ8IW19 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
APLFQ8IW19 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APLFQ8IW19 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APLFQ8IW19 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APLFQ8IW19 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APLFQ8IW19 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APLFQ8IW19 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APLFQ8IW19 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APLFQ8IW19 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
APLFQ8IW19 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APLFQ8IW19 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APLFQ8IW19 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APLFQ8IW19 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APLFQ8IW19 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APLFQ8IW19 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APLFQ8IW19 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APLFQ8IW19 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APLFQ8IW19 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLFQ8IW19 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APLFQ8IW19 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APLFQ8IW19 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APLFQ8IW19 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLFQ8IW19 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APLFQ8IW19 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APLFQ8IW19 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APLFQ8IW19 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APLFQ8IW19 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APLFQ8IW19 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APLFQ8IW19 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
APLFQ8IW19 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APLFQ8IW19 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APLFQ8IW19 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
APLFQ8IW19 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APLFQ8IW19 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APLFQ8IW19 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APLFQ8IW19 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APLFQ8IW19 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APLFQ8IW19 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APLFQ8IW19 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APLFQ8IW19 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APLFQ8IW19 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APLFQ8IW19 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APLFQ8IW19 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APLFQ8IW19 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
APLFQ8IW19 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
APLFQ8IW19 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APLFQ8IW19 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APLFQ8IW19 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APLFQ8IW19 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
APLFQ8IW19 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APLFQ8IW19 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APLFQ8IW19 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APLFQ8IW19 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APLFQ8IW19 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APLFQ8IW19 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APLFQ8IW19 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APLFQ8IW19 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APLFQ8IW19 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
APLFQ8IW19 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APLFQ8IW19 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
APLFQ8IW19 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APLFQ8IW19 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APLFQ8IW19 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
APLFQ8IW19 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APLFQ8IW19 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APLFQ8IW19 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APLFQ8IW19 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APLFQ8IW19 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APLFQ8IW19 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APLFQ8IW19 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APLFQ8IW19 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APLFQ8IW19 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APLFQ8IW19 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms