Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYT12Q8IV01 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYT12Q8IV01 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYT12Q8IV01 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYT12Q8IV01 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYT12Q8IV01 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYT12Q8IV01 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYT12Q8IV01 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYT12Q8IV01 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYT12Q8IV01 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYT12Q8IV01 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYT12Q8IV01 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYT12Q8IV01 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYT12Q8IV01 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYT12Q8IV01 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYT12Q8IV01 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYT12Q8IV01 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYT12Q8IV01 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYT12Q8IV01 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYT12Q8IV01 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYT12Q8IV01 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYT12Q8IV01 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYT12Q8IV01 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYT12Q8IV01 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYT12Q8IV01 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYT12Q8IV01 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYT12Q8IV01 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYT12Q8IV01 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYT12Q8IV01 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYT12Q8IV01 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SYT12Q8IV01 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYT12Q8IV01 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYT12Q8IV01 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYT12Q8IV01 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYT12Q8IV01 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT12Q8IV01 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYT12Q8IV01 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SYT12Q8IV01 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT12Q8IV01 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT12Q8IV01 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYT12Q8IV01 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYT12Q8IV01 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYT12Q8IV01 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYT12Q8IV01 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYT12Q8IV01 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYT12Q8IV01 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYT12Q8IV01 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYT12Q8IV01 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYT12Q8IV01 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SYT12Q8IV01 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYT12Q8IV01 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYT12Q8IV01 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYT12Q8IV01 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYT12Q8IV01 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYT12Q8IV01 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYT12Q8IV01 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYT12Q8IV01 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYT12Q8IV01 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYT12Q8IV01 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYT12Q8IV01 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYT12Q8IV01 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYT12Q8IV01 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYT12Q8IV01 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYT12Q8IV01 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYT12Q8IV01 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYT12Q8IV01 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SYT12Q8IV01 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SYT12Q8IV01 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYT12Q8IV01 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYT12Q8IV01 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYT12Q8IV01 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYT12Q8IV01 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYT12Q8IV01 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYT12Q8IV01 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYT12Q8IV01 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYT12Q8IV01 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYT12Q8IV01 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYT12Q8IV01 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SYT12Q8IV01 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYT12Q8IV01 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYT12Q8IV01 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SYT12Q8IV01 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms