Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC49Q8IUZ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC49Q8IUZ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC49Q8IUZ0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC49Q8IUZ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC49Q8IUZ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC49Q8IUZ0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC49Q8IUZ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC49Q8IUZ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC49Q8IUZ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC49Q8IUZ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC49Q8IUZ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC49Q8IUZ0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC49Q8IUZ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC49Q8IUZ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC49Q8IUZ0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC49Q8IUZ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC49Q8IUZ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC49Q8IUZ0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC49Q8IUZ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC49Q8IUZ0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC49Q8IUZ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC49Q8IUZ0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC49Q8IUZ0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC49Q8IUZ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC49Q8IUZ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC49Q8IUZ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC49Q8IUZ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC49Q8IUZ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC49Q8IUZ0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC49Q8IUZ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC49Q8IUZ0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC49Q8IUZ0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC49Q8IUZ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRRC49Q8IUZ0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC49Q8IUZ0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC49Q8IUZ0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC49Q8IUZ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC49Q8IUZ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC49Q8IUZ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC49Q8IUZ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC49Q8IUZ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC49Q8IUZ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC49Q8IUZ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC49Q8IUZ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC49Q8IUZ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC49Q8IUZ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC49Q8IUZ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC49Q8IUZ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC49Q8IUZ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC49Q8IUZ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC49Q8IUZ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC49Q8IUZ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC49Q8IUZ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC49Q8IUZ0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC49Q8IUZ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC49Q8IUZ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC49Q8IUZ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC49Q8IUZ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC49Q8IUZ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC49Q8IUZ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC49Q8IUZ0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC49Q8IUZ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC49Q8IUZ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms