Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HAPLN4Q86UW8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HAPLN4Q86UW8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HAPLN4Q86UW8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HAPLN4Q86UW8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HAPLN4Q86UW8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HAPLN4Q86UW8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HAPLN4Q86UW8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HAPLN4Q86UW8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HAPLN4Q86UW8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HAPLN4Q86UW8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HAPLN4Q86UW8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HAPLN4Q86UW8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HAPLN4Q86UW8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HAPLN4Q86UW8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HAPLN4Q86UW8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HAPLN4Q86UW8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HAPLN4Q86UW8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HAPLN4Q86UW8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HAPLN4Q86UW8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HAPLN4Q86UW8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HAPLN4Q86UW8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HAPLN4Q86UW8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HAPLN4Q86UW8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HAPLN4Q86UW8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HAPLN4Q86UW8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HAPLN4Q86UW8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HAPLN4Q86UW8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HAPLN4Q86UW8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HAPLN4Q86UW8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HAPLN4Q86UW8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HAPLN4Q86UW8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HAPLN4Q86UW8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HAPLN4Q86UW8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HAPLN4Q86UW8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HAPLN4Q86UW8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HAPLN4Q86UW8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HAPLN4Q86UW8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HAPLN4Q86UW8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HAPLN4Q86UW8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HAPLN4Q86UW8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HAPLN4Q86UW8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HAPLN4Q86UW8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HAPLN4Q86UW8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HAPLN4Q86UW8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HAPLN4Q86UW8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HAPLN4Q86UW8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HAPLN4Q86UW8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HAPLN4Q86UW8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HAPLN4Q86UW8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HAPLN4Q86UW8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HAPLN4Q86UW8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HAPLN4Q86UW8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HAPLN4Q86UW8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HAPLN4Q86UW8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HAPLN4Q86UW8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HAPLN4Q86UW8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HAPLN4Q86UW8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HAPLN4Q86UW8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HAPLN4Q86UW8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HAPLN4Q86UW8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HAPLN4Q86UW8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HAPLN4Q86UW8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HAPLN4Q86UW8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HAPLN4Q86UW8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HAPLN4Q86UW8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HAPLN4Q86UW8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HAPLN4Q86UW8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HAPLN4Q86UW8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HAPLN4Q86UW8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HAPLN4Q86UW8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HAPLN4Q86UW8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAPLN4Q86UW8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HAPLN4Q86UW8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAPLN4Q86UW8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAPLN4Q86UW8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HAPLN4Q86UW8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAPLN4Q86UW8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HAPLN4Q86UW8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HAPLN4Q86UW8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms