Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC6BQ86SZ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC6BQ86SZ2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC6BQ86SZ2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC6BQ86SZ2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC6BQ86SZ2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC6BQ86SZ2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC6BQ86SZ2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC6BQ86SZ2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC6BQ86SZ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC6BQ86SZ2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC6BQ86SZ2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC6BQ86SZ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC6BQ86SZ2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC6BQ86SZ2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC6BQ86SZ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC6BQ86SZ2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC6BQ86SZ2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC6BQ86SZ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC6BQ86SZ2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC6BQ86SZ2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC6BQ86SZ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC6BQ86SZ2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC6BQ86SZ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC6BQ86SZ2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC6BQ86SZ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC6BQ86SZ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms