Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDF3Q7Z739 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDF3Q7Z739 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDF3Q7Z739 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YTHDF3Q7Z739 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
YTHDF3Q7Z739 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
YTHDF3Q7Z739 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
YTHDF3Q7Z739 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDF3Q7Z739 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDF3Q7Z739 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
YTHDF3Q7Z739 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDF3Q7Z739 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDF3Q7Z739 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
YTHDF3Q7Z739 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
YTHDF3Q7Z739 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDF3Q7Z739 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDF3Q7Z739 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
YTHDF3Q7Z739 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
YTHDF3Q7Z739 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDF3Q7Z739 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
YTHDF3Q7Z739 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDF3Q7Z739 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDF3Q7Z739 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDF3Q7Z739 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDF3Q7Z739 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDF3Q7Z739 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
YTHDF3Q7Z739 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDF3Q7Z739 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDF3Q7Z739 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDF3Q7Z739 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDF3Q7Z739 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDF3Q7Z739 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDF3Q7Z739 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDF3Q7Z739 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDF3Q7Z739 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDF3Q7Z739 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDF3Q7Z739 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDF3Q7Z739 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDF3Q7Z739 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
YTHDF3Q7Z739 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
YTHDF3Q7Z739 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
YTHDF3Q7Z739 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
YTHDF3Q7Z739 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
YTHDF3Q7Z739 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YTHDF3Q7Z739 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YTHDF3Q7Z739 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
YTHDF3Q7Z739 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
YTHDF3Q7Z739 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
YTHDF3Q7Z739 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
YTHDF3Q7Z739 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
YTHDF3Q7Z739 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
YTHDF3Q7Z739 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
YTHDF3Q7Z739 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
YTHDF3Q7Z739 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
YTHDF3Q7Z739 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
YTHDF3Q7Z739 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
YTHDF3Q7Z739 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
YTHDF3Q7Z739 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
YTHDF3Q7Z739 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
YTHDF3Q7Z739 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
YTHDF3Q7Z739 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
YTHDF3Q7Z739 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
YTHDF3Q7Z739 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
YTHDF3Q7Z739 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
YTHDF3Q7Z739 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
YTHDF3Q7Z739 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
YTHDF3Q7Z739 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
YTHDF3Q7Z739 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
YTHDF3Q7Z739 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
YTHDF3Q7Z739 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
YTHDF3Q7Z739 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
YTHDF3Q7Z739 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
YTHDF3Q7Z739 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDF3Q7Z739 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDF3Q7Z739 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
YTHDF3Q7Z739 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDF3Q7Z739 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YTHDF3Q7Z739 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDF3Q7Z739 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDF3Q7Z739 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDF3Q7Z739 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDF3Q7Z739 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
YTHDF3Q7Z739 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms