Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PPP1R42Q7Z4L9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PPP1R42Q7Z4L9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PPP1R42Q7Z4L9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PPP1R42Q7Z4L9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PPP1R42Q7Z4L9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PPP1R42Q7Z4L9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PPP1R42Q7Z4L9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PPP1R42Q7Z4L9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PPP1R42Q7Z4L9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PPP1R42Q7Z4L9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PPP1R42Q7Z4L9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PPP1R42Q7Z4L9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PPP1R42Q7Z4L9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PPP1R42Q7Z4L9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PPP1R42Q7Z4L9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PPP1R42Q7Z4L9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PPP1R42Q7Z4L9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PPP1R42Q7Z4L9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PPP1R42Q7Z4L9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PPP1R42Q7Z4L9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PPP1R42Q7Z4L9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PPP1R42Q7Z4L9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PPP1R42Q7Z4L9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PPP1R42Q7Z4L9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PPP1R42Q7Z4L9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PPP1R42Q7Z4L9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PPP1R42Q7Z4L9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PPP1R42Q7Z4L9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PPP1R42Q7Z4L9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PPP1R42Q7Z4L9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PPP1R42Q7Z4L9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PPP1R42Q7Z4L9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PPP1R42Q7Z4L9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PPP1R42Q7Z4L9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PPP1R42Q7Z4L9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PPP1R42Q7Z4L9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PPP1R42Q7Z4L9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PPP1R42Q7Z4L9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PPP1R42Q7Z4L9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PPP1R42Q7Z4L9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PPP1R42Q7Z4L9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPP1R42Q7Z4L9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPP1R42Q7Z4L9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PPP1R42Q7Z4L9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPP1R42Q7Z4L9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PPP1R42Q7Z4L9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPP1R42Q7Z4L9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
PPP1R42Q7Z4L9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PPP1R42Q7Z4L9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPP1R42Q7Z4L9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPP1R42Q7Z4L9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PPP1R42Q7Z4L9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PPP1R42Q7Z4L9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPP1R42Q7Z4L9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPP1R42Q7Z4L9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPP1R42Q7Z4L9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PPP1R42Q7Z4L9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PPP1R42Q7Z4L9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PPP1R42Q7Z4L9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PPP1R42Q7Z4L9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PPP1R42Q7Z4L9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PPP1R42Q7Z4L9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PPP1R42Q7Z4L9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PPP1R42Q7Z4L9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPP1R42Q7Z4L9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPP1R42Q7Z4L9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PPP1R42Q7Z4L9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PPP1R42Q7Z4L9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PPP1R42Q7Z4L9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PPP1R42Q7Z4L9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PPP1R42Q7Z4L9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PPP1R42Q7Z4L9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPP1R42Q7Z4L9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPP1R42Q7Z4L9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPP1R42Q7Z4L9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPP1R42Q7Z4L9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPP1R42Q7Z4L9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPP1R42Q7Z4L9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPP1R42Q7Z4L9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPP1R42Q7Z4L9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPP1R42Q7Z4L9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPP1R42Q7Z4L9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PPP1R42Q7Z4L9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PPP1R42Q7Z4L9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PPP1R42Q7Z4L9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PPP1R42Q7Z4L9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPP1R42Q7Z4L9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPP1R42Q7Z4L9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPP1R42Q7Z4L9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PPP1R42Q7Z4L9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PPP1R42Q7Z4L9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PPP1R42Q7Z4L9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PPP1R42Q7Z4L9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PPP1R42Q7Z4L9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PPP1R42Q7Z4L9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms