Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF550Q7Z398 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF550Q7Z398 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF550Q7Z398 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF550Q7Z398 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF550Q7Z398 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF550Q7Z398 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF550Q7Z398 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF550Q7Z398 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF550Q7Z398 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF550Q7Z398 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF550Q7Z398 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF550Q7Z398 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF550Q7Z398 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF550Q7Z398 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF550Q7Z398 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF550Q7Z398 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF550Q7Z398 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF550Q7Z398 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF550Q7Z398 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF550Q7Z398 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF550Q7Z398 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF550Q7Z398 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF550Q7Z398 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF550Q7Z398 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF550Q7Z398 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF550Q7Z398 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF550Q7Z398 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF550Q7Z398 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF550Q7Z398 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF550Q7Z398 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF550Q7Z398 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF550Q7Z398 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF550Q7Z398 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF550Q7Z398 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF550Q7Z398 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF550Q7Z398 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF550Q7Z398 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF550Q7Z398 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF550Q7Z398 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF550Q7Z398 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF550Q7Z398 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF550Q7Z398 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF550Q7Z398 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF550Q7Z398 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF550Q7Z398 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF550Q7Z398 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF550Q7Z398 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF550Q7Z398 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF550Q7Z398 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF550Q7Z398 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF550Q7Z398 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF550Q7Z398 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF550Q7Z398 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF550Q7Z398 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF550Q7Z398 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF550Q7Z398 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF550Q7Z398 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF550Q7Z398 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF550Q7Z398 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF550Q7Z398 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF550Q7Z398 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF550Q7Z398 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF550Q7Z398 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF550Q7Z398 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF550Q7Z398 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF550Q7Z398 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF550Q7Z398 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF550Q7Z398 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF550Q7Z398 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF550Q7Z398 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF550Q7Z398 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF550Q7Z398 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF550Q7Z398 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF550Q7Z398 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF550Q7Z398 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF550Q7Z398 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF550Q7Z398 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF550Q7Z398 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF550Q7Z398 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF550Q7Z398 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF550Q7Z398 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF550Q7Z398 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF550Q7Z398 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF550Q7Z398 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF550Q7Z398 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF550Q7Z398 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF550Q7Z398 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF550Q7Z398 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF550Q7Z398 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF550Q7Z398 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF550Q7Z398 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF550Q7Z398 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF550Q7Z398 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF550Q7Z398 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF550Q7Z398 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF550Q7Z398 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF550Q7Z398 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF550Q7Z398 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF550Q7Z398 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms