Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MICAL3Q7RTP6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MICAL3Q7RTP6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MICAL3Q7RTP6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MICAL3Q7RTP6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MICAL3Q7RTP6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MICAL3Q7RTP6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MICAL3Q7RTP6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MICAL3Q7RTP6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MICAL3Q7RTP6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MICAL3Q7RTP6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MICAL3Q7RTP6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MICAL3Q7RTP6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MICAL3Q7RTP6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MICAL3Q7RTP6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MICAL3Q7RTP6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MICAL3Q7RTP6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MICAL3Q7RTP6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MICAL3Q7RTP6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MICAL3Q7RTP6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MICAL3Q7RTP6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MICAL3Q7RTP6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MICAL3Q7RTP6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MICAL3Q7RTP6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MICAL3Q7RTP6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MICAL3Q7RTP6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
MICAL3Q7RTP6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MICAL3Q7RTP6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MICAL3Q7RTP6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MICAL3Q7RTP6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MICAL3Q7RTP6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MICAL3Q7RTP6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MICAL3Q7RTP6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MICAL3Q7RTP6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MICAL3Q7RTP6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MICAL3Q7RTP6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MICAL3Q7RTP6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MICAL3Q7RTP6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MICAL3Q7RTP6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MICAL3Q7RTP6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MICAL3Q7RTP6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MICAL3Q7RTP6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MICAL3Q7RTP6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MICAL3Q7RTP6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
MICAL3Q7RTP6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MICAL3Q7RTP6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MICAL3Q7RTP6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MICAL3Q7RTP6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MICAL3Q7RTP6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MICAL3Q7RTP6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MICAL3Q7RTP6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MICAL3Q7RTP6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MICAL3Q7RTP6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MICAL3Q7RTP6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MICAL3Q7RTP6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MICAL3Q7RTP6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MICAL3Q7RTP6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MICAL3Q7RTP6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MICAL3Q7RTP6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MICAL3Q7RTP6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MICAL3Q7RTP6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MICAL3Q7RTP6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MICAL3Q7RTP6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MICAL3Q7RTP6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MICAL3Q7RTP6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MICAL3Q7RTP6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MICAL3Q7RTP6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
MICAL3Q7RTP6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MICAL3Q7RTP6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MICAL3Q7RTP6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MICAL3Q7RTP6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MICAL3Q7RTP6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MICAL3Q7RTP6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MICAL3Q7RTP6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MICAL3Q7RTP6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MICAL3Q7RTP6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MICAL3Q7RTP6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MICAL3Q7RTP6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MICAL3Q7RTP6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MICAL3Q7RTP6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MICAL3Q7RTP6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MICAL3Q7RTP6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MICAL3Q7RTP6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms