Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCNI2Q6ZMN8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCNI2Q6ZMN8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNI2Q6ZMN8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNI2Q6ZMN8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNI2Q6ZMN8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNI2Q6ZMN8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNI2Q6ZMN8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNI2Q6ZMN8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCNI2Q6ZMN8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCNI2Q6ZMN8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCNI2Q6ZMN8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCNI2Q6ZMN8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCNI2Q6ZMN8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCNI2Q6ZMN8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCNI2Q6ZMN8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCNI2Q6ZMN8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNI2Q6ZMN8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNI2Q6ZMN8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNI2Q6ZMN8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNI2Q6ZMN8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNI2Q6ZMN8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNI2Q6ZMN8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNI2Q6ZMN8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNI2Q6ZMN8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCNI2Q6ZMN8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCNI2Q6ZMN8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNI2Q6ZMN8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNI2Q6ZMN8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCNI2Q6ZMN8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNI2Q6ZMN8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNI2Q6ZMN8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNI2Q6ZMN8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNI2Q6ZMN8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNI2Q6ZMN8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNI2Q6ZMN8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNI2Q6ZMN8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNI2Q6ZMN8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNI2Q6ZMN8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCNI2Q6ZMN8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNI2Q6ZMN8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCNI2Q6ZMN8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNI2Q6ZMN8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNI2Q6ZMN8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNI2Q6ZMN8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNI2Q6ZMN8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNI2Q6ZMN8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNI2Q6ZMN8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNI2Q6ZMN8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCNI2Q6ZMN8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNI2Q6ZMN8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCNI2Q6ZMN8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNI2Q6ZMN8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNI2Q6ZMN8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNI2Q6ZMN8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCNI2Q6ZMN8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNI2Q6ZMN8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNI2Q6ZMN8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNI2Q6ZMN8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNI2Q6ZMN8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNI2Q6ZMN8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCNI2Q6ZMN8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNI2Q6ZMN8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCNI2Q6ZMN8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCNI2Q6ZMN8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNI2Q6ZMN8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCNI2Q6ZMN8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCNI2Q6ZMN8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCNI2Q6ZMN8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCNI2Q6ZMN8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNI2Q6ZMN8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCNI2Q6ZMN8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CCNI2Q6ZMN8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CCNI2Q6ZMN8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNI2Q6ZMN8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCNI2Q6ZMN8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCNI2Q6ZMN8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNI2Q6ZMN8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCNI2Q6ZMN8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNI2Q6ZMN8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNI2Q6ZMN8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNI2Q6ZMN8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNI2Q6ZMN8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNI2Q6ZMN8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNI2Q6ZMN8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNI2Q6ZMN8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNI2Q6ZMN8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNI2Q6ZMN8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNI2Q6ZMN8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNI2Q6ZMN8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNI2Q6ZMN8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNI2Q6ZMN8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNI2Q6ZMN8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNI2Q6ZMN8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNI2Q6ZMN8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNI2Q6ZMN8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNI2Q6ZMN8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNI2Q6ZMN8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNI2Q6ZMN8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNI2Q6ZMN8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms