Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
CD109Q6YHK3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
CD109Q6YHK3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CD109Q6YHK3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
CD109Q6YHK3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
CD109Q6YHK3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
CD109Q6YHK3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CD109Q6YHK3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CD109Q6YHK3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CD109Q6YHK3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CD109Q6YHK3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CD109Q6YHK3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.46
CD109Q6YHK3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC42.88■■■■■ 4.45
CD109Q6YHK3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CD109Q6YHK3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CD109Q6YHK3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CD109Q6YHK3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CD109Q6YHK3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
CD109Q6YHK3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
CD109Q6YHK3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
CD109Q6YHK3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CD109Q6YHK3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CD109Q6YHK3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CD109Q6YHK3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CD109Q6YHK3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CD109Q6YHK3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CD109Q6YHK3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CD109Q6YHK3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CD109Q6YHK3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
CD109Q6YHK3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
CD109Q6YHK3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
CD109Q6YHK3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CD109Q6YHK3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
CD109Q6YHK3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CD109Q6YHK3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
CD109Q6YHK3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CD109Q6YHK3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CD109Q6YHK3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CD109Q6YHK3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
CD109Q6YHK3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
CD109Q6YHK3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.63■■■■■ 4.42
CD109Q6YHK3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
CD109Q6YHK3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
CD109Q6YHK3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
CD109Q6YHK3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CD109Q6YHK3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CD109Q6YHK3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CD109Q6YHK3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CD109Q6YHK3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.6■■■■■ 4.41
CD109Q6YHK3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
CD109Q6YHK3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.6■■■■■ 4.41
CD109Q6YHK3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CD109Q6YHK3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
CD109Q6YHK3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
CD109Q6YHK3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CD109Q6YHK3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CD109Q6YHK3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
CD109Q6YHK3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
CD109Q6YHK3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CD109Q6YHK3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
CD109Q6YHK3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CD109Q6YHK3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CD109Q6YHK3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CD109Q6YHK3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CD109Q6YHK3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
CD109Q6YHK3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
CD109Q6YHK3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
CD109Q6YHK3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CD109Q6YHK3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CD109Q6YHK3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
CD109Q6YHK3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CD109Q6YHK3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
CD109Q6YHK3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CD109Q6YHK3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
CD109Q6YHK3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
CD109Q6YHK3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
CD109Q6YHK3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CD109Q6YHK3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CD109Q6YHK3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
CD109Q6YHK3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CD109Q6YHK3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CD109Q6YHK3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CD109Q6YHK3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CD109Q6YHK3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CD109Q6YHK3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
CD109Q6YHK3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CD109Q6YHK3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CD109Q6YHK3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CD109Q6YHK3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CD109Q6YHK3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CD109Q6YHK3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CD109Q6YHK3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CD109Q6YHK3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
CD109Q6YHK3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CD109Q6YHK3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CD109Q6YHK3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CD109Q6YHK3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
CD109Q6YHK3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CD109Q6YHK3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CD109Q6YHK3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms