Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TPTE2Q6XPS3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TPTE2Q6XPS3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TPTE2Q6XPS3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TPTE2Q6XPS3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TPTE2Q6XPS3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TPTE2Q6XPS3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TPTE2Q6XPS3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TPTE2Q6XPS3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TPTE2Q6XPS3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TPTE2Q6XPS3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TPTE2Q6XPS3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TPTE2Q6XPS3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TPTE2Q6XPS3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
TPTE2Q6XPS3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TPTE2Q6XPS3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TPTE2Q6XPS3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TPTE2Q6XPS3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TPTE2Q6XPS3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TPTE2Q6XPS3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TPTE2Q6XPS3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TPTE2Q6XPS3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TPTE2Q6XPS3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TPTE2Q6XPS3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
TPTE2Q6XPS3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TPTE2Q6XPS3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TPTE2Q6XPS3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TPTE2Q6XPS3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TPTE2Q6XPS3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TPTE2Q6XPS3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TPTE2Q6XPS3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TPTE2Q6XPS3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TPTE2Q6XPS3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TPTE2Q6XPS3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TPTE2Q6XPS3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TPTE2Q6XPS3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TPTE2Q6XPS3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TPTE2Q6XPS3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TPTE2Q6XPS3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TPTE2Q6XPS3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TPTE2Q6XPS3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TPTE2Q6XPS3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TPTE2Q6XPS3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TPTE2Q6XPS3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TPTE2Q6XPS3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TPTE2Q6XPS3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TPTE2Q6XPS3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TPTE2Q6XPS3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TPTE2Q6XPS3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TPTE2Q6XPS3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TPTE2Q6XPS3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TPTE2Q6XPS3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TPTE2Q6XPS3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
TPTE2Q6XPS3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TPTE2Q6XPS3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TPTE2Q6XPS3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TPTE2Q6XPS3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TPTE2Q6XPS3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TPTE2Q6XPS3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TPTE2Q6XPS3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TPTE2Q6XPS3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TPTE2Q6XPS3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TPTE2Q6XPS3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TPTE2Q6XPS3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TPTE2Q6XPS3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TPTE2Q6XPS3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TPTE2Q6XPS3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TPTE2Q6XPS3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TPTE2Q6XPS3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TPTE2Q6XPS3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TPTE2Q6XPS3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TPTE2Q6XPS3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TPTE2Q6XPS3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TPTE2Q6XPS3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TPTE2Q6XPS3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
TPTE2Q6XPS3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TPTE2Q6XPS3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TPTE2Q6XPS3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TPTE2Q6XPS3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TPTE2Q6XPS3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TPTE2Q6XPS3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TPTE2Q6XPS3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TPTE2Q6XPS3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TPTE2Q6XPS3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TPTE2Q6XPS3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TPTE2Q6XPS3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TPTE2Q6XPS3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TPTE2Q6XPS3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
TPTE2Q6XPS3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TPTE2Q6XPS3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TPTE2Q6XPS3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TPTE2Q6XPS3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
TPTE2Q6XPS3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TPTE2Q6XPS3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TPTE2Q6XPS3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TPTE2Q6XPS3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TPTE2Q6XPS3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TPTE2Q6XPS3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TPTE2Q6XPS3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TPTE2Q6XPS3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms