Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MUC6Q6W4X9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MUC6Q6W4X9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MUC6Q6W4X9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MUC6Q6W4X9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MUC6Q6W4X9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MUC6Q6W4X9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MUC6Q6W4X9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MUC6Q6W4X9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MUC6Q6W4X9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MUC6Q6W4X9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MUC6Q6W4X9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MUC6Q6W4X9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MUC6Q6W4X9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MUC6Q6W4X9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MUC6Q6W4X9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MUC6Q6W4X9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MUC6Q6W4X9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MUC6Q6W4X9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MUC6Q6W4X9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MUC6Q6W4X9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MUC6Q6W4X9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MUC6Q6W4X9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MUC6Q6W4X9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MUC6Q6W4X9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MUC6Q6W4X9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MUC6Q6W4X9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MUC6Q6W4X9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MUC6Q6W4X9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MUC6Q6W4X9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MUC6Q6W4X9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MUC6Q6W4X9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MUC6Q6W4X9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MUC6Q6W4X9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MUC6Q6W4X9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MUC6Q6W4X9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MUC6Q6W4X9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MUC6Q6W4X9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MUC6Q6W4X9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MUC6Q6W4X9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MUC6Q6W4X9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MUC6Q6W4X9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MUC6Q6W4X9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MUC6Q6W4X9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MUC6Q6W4X9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MUC6Q6W4X9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MUC6Q6W4X9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MUC6Q6W4X9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MUC6Q6W4X9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MUC6Q6W4X9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MUC6Q6W4X9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MUC6Q6W4X9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MUC6Q6W4X9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MUC6Q6W4X9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MUC6Q6W4X9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MUC6Q6W4X9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MUC6Q6W4X9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MUC6Q6W4X9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MUC6Q6W4X9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MUC6Q6W4X9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MUC6Q6W4X9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MUC6Q6W4X9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MUC6Q6W4X9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MUC6Q6W4X9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MUC6Q6W4X9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MUC6Q6W4X9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MUC6Q6W4X9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MUC6Q6W4X9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MUC6Q6W4X9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MUC6Q6W4X9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MUC6Q6W4X9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MUC6Q6W4X9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MUC6Q6W4X9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MUC6Q6W4X9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MUC6Q6W4X9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MUC6Q6W4X9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MUC6Q6W4X9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MUC6Q6W4X9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MUC6Q6W4X9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MUC6Q6W4X9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MUC6Q6W4X9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MUC6Q6W4X9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MUC6Q6W4X9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MUC6Q6W4X9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MUC6Q6W4X9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MUC6Q6W4X9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MUC6Q6W4X9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MUC6Q6W4X9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MUC6Q6W4X9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MUC6Q6W4X9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MUC6Q6W4X9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MUC6Q6W4X9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MUC6Q6W4X9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MUC6Q6W4X9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MUC6Q6W4X9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MUC6Q6W4X9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MUC6Q6W4X9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MUC6Q6W4X9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MUC6Q6W4X9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MUC6Q6W4X9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms