Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXV0

GFRAL, GDNF family receptor alpha-like, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRALQ6UXV0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GFRALQ6UXV0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GFRALQ6UXV0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GFRALQ6UXV0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GFRALQ6UXV0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRALQ6UXV0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRALQ6UXV0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRALQ6UXV0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRALQ6UXV0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFRALQ6UXV0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFRALQ6UXV0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFRALQ6UXV0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GFRALQ6UXV0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GFRALQ6UXV0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GFRALQ6UXV0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GFRALQ6UXV0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRALQ6UXV0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRALQ6UXV0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRALQ6UXV0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRALQ6UXV0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GFRALQ6UXV0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFRALQ6UXV0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFRALQ6UXV0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFRALQ6UXV0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFRALQ6UXV0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GFRALQ6UXV0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GFRALQ6UXV0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GFRALQ6UXV0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GFRALQ6UXV0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GFRALQ6UXV0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFRALQ6UXV0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFRALQ6UXV0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFRALQ6UXV0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GFRALQ6UXV0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GFRALQ6UXV0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GFRALQ6UXV0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GFRALQ6UXV0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GFRALQ6UXV0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GFRALQ6UXV0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GFRALQ6UXV0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GFRALQ6UXV0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFRALQ6UXV0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GFRALQ6UXV0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GFRALQ6UXV0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GFRALQ6UXV0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GFRALQ6UXV0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRALQ6UXV0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRALQ6UXV0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GFRALQ6UXV0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRALQ6UXV0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GFRALQ6UXV0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GFRALQ6UXV0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GFRALQ6UXV0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GFRALQ6UXV0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GFRALQ6UXV0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GFRALQ6UXV0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRALQ6UXV0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRALQ6UXV0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRALQ6UXV0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRALQ6UXV0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GFRALQ6UXV0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRALQ6UXV0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRALQ6UXV0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRALQ6UXV0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRALQ6UXV0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRALQ6UXV0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRALQ6UXV0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GFRALQ6UXV0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GFRALQ6UXV0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GFRALQ6UXV0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GFRALQ6UXV0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GFRALQ6UXV0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GFRALQ6UXV0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GFRALQ6UXV0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GFRALQ6UXV0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GFRALQ6UXV0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GFRALQ6UXV0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GFRALQ6UXV0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFRALQ6UXV0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GFRALQ6UXV0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GFRALQ6UXV0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms