Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREML4Q6UXN2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREML4Q6UXN2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREML4Q6UXN2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREML4Q6UXN2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREML4Q6UXN2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREML4Q6UXN2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREML4Q6UXN2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREML4Q6UXN2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TREML4Q6UXN2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TREML4Q6UXN2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TREML4Q6UXN2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREML4Q6UXN2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TREML4Q6UXN2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREML4Q6UXN2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML4Q6UXN2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML4Q6UXN2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREML4Q6UXN2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TREML4Q6UXN2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREML4Q6UXN2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREML4Q6UXN2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREML4Q6UXN2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREML4Q6UXN2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREML4Q6UXN2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREML4Q6UXN2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREML4Q6UXN2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREML4Q6UXN2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREML4Q6UXN2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREML4Q6UXN2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREML4Q6UXN2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREML4Q6UXN2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREML4Q6UXN2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREML4Q6UXN2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREML4Q6UXN2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TREML4Q6UXN2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREML4Q6UXN2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREML4Q6UXN2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREML4Q6UXN2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREML4Q6UXN2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREML4Q6UXN2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREML4Q6UXN2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREML4Q6UXN2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREML4Q6UXN2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREML4Q6UXN2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREML4Q6UXN2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREML4Q6UXN2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREML4Q6UXN2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREML4Q6UXN2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREML4Q6UXN2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREML4Q6UXN2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREML4Q6UXN2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREML4Q6UXN2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREML4Q6UXN2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML4Q6UXN2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML4Q6UXN2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREML4Q6UXN2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREML4Q6UXN2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREML4Q6UXN2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREML4Q6UXN2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREML4Q6UXN2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms