Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCSK4Q6UW60 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCSK4Q6UW60 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK4Q6UW60 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK4Q6UW60 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCSK4Q6UW60 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCSK4Q6UW60 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCSK4Q6UW60 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCSK4Q6UW60 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCSK4Q6UW60 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCSK4Q6UW60 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCSK4Q6UW60 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCSK4Q6UW60 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK4Q6UW60 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK4Q6UW60 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK4Q6UW60 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK4Q6UW60 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK4Q6UW60 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK4Q6UW60 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK4Q6UW60 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCSK4Q6UW60 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK4Q6UW60 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCSK4Q6UW60 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCSK4Q6UW60 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK4Q6UW60 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK4Q6UW60 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK4Q6UW60 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK4Q6UW60 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK4Q6UW60 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCSK4Q6UW60 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCSK4Q6UW60 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCSK4Q6UW60 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCSK4Q6UW60 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCSK4Q6UW60 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCSK4Q6UW60 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCSK4Q6UW60 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCSK4Q6UW60 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCSK4Q6UW60 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCSK4Q6UW60 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCSK4Q6UW60 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK4Q6UW60 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCSK4Q6UW60 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCSK4Q6UW60 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCSK4Q6UW60 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCSK4Q6UW60 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCSK4Q6UW60 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCSK4Q6UW60 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCSK4Q6UW60 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK4Q6UW60 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCSK4Q6UW60 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCSK4Q6UW60 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCSK4Q6UW60 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PCSK4Q6UW60 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCSK4Q6UW60 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCSK4Q6UW60 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCSK4Q6UW60 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCSK4Q6UW60 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCSK4Q6UW60 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCSK4Q6UW60 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCSK4Q6UW60 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCSK4Q6UW60 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCSK4Q6UW60 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCSK4Q6UW60 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCSK4Q6UW60 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCSK4Q6UW60 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCSK4Q6UW60 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCSK4Q6UW60 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCSK4Q6UW60 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCSK4Q6UW60 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCSK4Q6UW60 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCSK4Q6UW60 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PCSK4Q6UW60 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PCSK4Q6UW60 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PCSK4Q6UW60 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCSK4Q6UW60 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCSK4Q6UW60 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCSK4Q6UW60 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCSK4Q6UW60 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCSK4Q6UW60 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCSK4Q6UW60 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCSK4Q6UW60 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCSK4Q6UW60 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCSK4Q6UW60 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCSK4Q6UW60 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCSK4Q6UW60 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCSK4Q6UW60 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCSK4Q6UW60 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCSK4Q6UW60 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCSK4Q6UW60 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCSK4Q6UW60 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK4Q6UW60 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms