Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY0

BLOC1S3, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S3Q6QNY0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BLOC1S3Q6QNY0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BLOC1S3Q6QNY0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BLOC1S3Q6QNY0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BLOC1S3Q6QNY0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BLOC1S3Q6QNY0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BLOC1S3Q6QNY0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BLOC1S3Q6QNY0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BLOC1S3Q6QNY0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BLOC1S3Q6QNY0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BLOC1S3Q6QNY0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BLOC1S3Q6QNY0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BLOC1S3Q6QNY0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BLOC1S3Q6QNY0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BLOC1S3Q6QNY0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BLOC1S3Q6QNY0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BLOC1S3Q6QNY0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BLOC1S3Q6QNY0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BLOC1S3Q6QNY0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BLOC1S3Q6QNY0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BLOC1S3Q6QNY0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BLOC1S3Q6QNY0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BLOC1S3Q6QNY0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BLOC1S3Q6QNY0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BLOC1S3Q6QNY0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BLOC1S3Q6QNY0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BLOC1S3Q6QNY0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BLOC1S3Q6QNY0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BLOC1S3Q6QNY0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BLOC1S3Q6QNY0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BLOC1S3Q6QNY0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BLOC1S3Q6QNY0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BLOC1S3Q6QNY0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BLOC1S3Q6QNY0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BLOC1S3Q6QNY0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BLOC1S3Q6QNY0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BLOC1S3Q6QNY0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BLOC1S3Q6QNY0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BLOC1S3Q6QNY0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BLOC1S3Q6QNY0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BLOC1S3Q6QNY0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BLOC1S3Q6QNY0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BLOC1S3Q6QNY0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BLOC1S3Q6QNY0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BLOC1S3Q6QNY0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BLOC1S3Q6QNY0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BLOC1S3Q6QNY0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BLOC1S3Q6QNY0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BLOC1S3Q6QNY0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BLOC1S3Q6QNY0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S3Q6QNY0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S3Q6QNY0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S3Q6QNY0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S3Q6QNY0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S3Q6QNY0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S3Q6QNY0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S3Q6QNY0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BLOC1S3Q6QNY0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BLOC1S3Q6QNY0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BLOC1S3Q6QNY0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLOC1S3Q6QNY0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BLOC1S3Q6QNY0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLOC1S3Q6QNY0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLOC1S3Q6QNY0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLOC1S3Q6QNY0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BLOC1S3Q6QNY0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BLOC1S3Q6QNY0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BLOC1S3Q6QNY0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BLOC1S3Q6QNY0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BLOC1S3Q6QNY0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BLOC1S3Q6QNY0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BLOC1S3Q6QNY0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BLOC1S3Q6QNY0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BLOC1S3Q6QNY0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BLOC1S3Q6QNY0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BLOC1S3Q6QNY0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BLOC1S3Q6QNY0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BLOC1S3Q6QNY0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BLOC1S3Q6QNY0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BLOC1S3Q6QNY0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BLOC1S3Q6QNY0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BLOC1S3Q6QNY0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BLOC1S3Q6QNY0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BLOC1S3Q6QNY0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BLOC1S3Q6QNY0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BLOC1S3Q6QNY0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BLOC1S3Q6QNY0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
BLOC1S3Q6QNY0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BLOC1S3Q6QNY0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BLOC1S3Q6QNY0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BLOC1S3Q6QNY0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BLOC1S3Q6QNY0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BLOC1S3Q6QNY0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BLOC1S3Q6QNY0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BLOC1S3Q6QNY0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BLOC1S3Q6QNY0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BLOC1S3Q6QNY0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BLOC1S3Q6QNY0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms