Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6Q795 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6Q795 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6Q795 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6Q795 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6Q795 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6Q795 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6Q795 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6Q795 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6Q795 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6Q795 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6Q795 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6Q795 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6Q795 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6Q795 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6Q795 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6Q795 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6Q795 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6Q795 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6Q795 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6Q795 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6Q795 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6Q795 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6Q795 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6Q795 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6Q795 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6Q795 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6Q795 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6Q795 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6Q795 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6Q795 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6Q795 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6Q795 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6Q795 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6Q795 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6Q795 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6Q795 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6Q795 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6Q795 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6Q795 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6Q795 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6Q795 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6Q795 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6Q795 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6Q795 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6Q795 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6Q795 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q6Q795 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6Q795 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q6Q795 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6Q795 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6Q795 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q6Q795 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6Q795 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6Q795 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6Q795 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6Q795 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6Q795 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6Q795 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6Q795 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6Q795 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6Q795 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6Q795 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6Q795 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6Q795 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6Q795 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6Q795 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6Q795 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6Q795 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6Q795 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6Q795 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6Q795 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6Q795 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6Q795 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6Q795 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6Q795 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6Q795 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6Q795 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6Q795 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6Q795 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6Q795 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6Q795 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6Q795 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6Q795 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6Q795 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q6Q795 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6Q795 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q6Q795 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q6Q795 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q6Q795 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6Q795 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6Q795 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6Q795 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6Q795 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6Q795 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6Q795 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6Q795 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6Q795 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6Q795 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6Q795 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms