Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RGMBQ6NW40 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RGMBQ6NW40 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RGMBQ6NW40 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
RGMBQ6NW40 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RGMBQ6NW40 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RGMBQ6NW40 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RGMBQ6NW40 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RGMBQ6NW40 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RGMBQ6NW40 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RGMBQ6NW40 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RGMBQ6NW40 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGMBQ6NW40 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGMBQ6NW40 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGMBQ6NW40 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGMBQ6NW40 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGMBQ6NW40 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGMBQ6NW40 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RGMBQ6NW40 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RGMBQ6NW40 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RGMBQ6NW40 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RGMBQ6NW40 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RGMBQ6NW40 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RGMBQ6NW40 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RGMBQ6NW40 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGMBQ6NW40 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGMBQ6NW40 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGMBQ6NW40 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
RGMBQ6NW40 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RGMBQ6NW40 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RGMBQ6NW40 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
RGMBQ6NW40 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RGMBQ6NW40 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RGMBQ6NW40 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RGMBQ6NW40 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RGMBQ6NW40 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RGMBQ6NW40 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RGMBQ6NW40 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RGMBQ6NW40 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGMBQ6NW40 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RGMBQ6NW40 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RGMBQ6NW40 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RGMBQ6NW40 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
RGMBQ6NW40 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RGMBQ6NW40 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RGMBQ6NW40 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RGMBQ6NW40 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RGMBQ6NW40 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RGMBQ6NW40 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RGMBQ6NW40 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
RGMBQ6NW40 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RGMBQ6NW40 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
RGMBQ6NW40 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
RGMBQ6NW40 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
RGMBQ6NW40 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RGMBQ6NW40 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RGMBQ6NW40 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RGMBQ6NW40 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGMBQ6NW40 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGMBQ6NW40 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RGMBQ6NW40 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RGMBQ6NW40 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RGMBQ6NW40 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RGMBQ6NW40 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RGMBQ6NW40 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RGMBQ6NW40 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
RGMBQ6NW40 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
RGMBQ6NW40 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RGMBQ6NW40 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RGMBQ6NW40 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RGMBQ6NW40 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RGMBQ6NW40 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
RGMBQ6NW40 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGMBQ6NW40 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGMBQ6NW40 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGMBQ6NW40 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RGMBQ6NW40 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RGMBQ6NW40 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RGMBQ6NW40 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RGMBQ6NW40 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGMBQ6NW40 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RGMBQ6NW40 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms