Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX3

TCEAL6, Transcription elongation factor A protein-like 6, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL6Q6IPX3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCEAL6Q6IPX3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCEAL6Q6IPX3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCEAL6Q6IPX3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCEAL6Q6IPX3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCEAL6Q6IPX3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCEAL6Q6IPX3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCEAL6Q6IPX3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCEAL6Q6IPX3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCEAL6Q6IPX3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCEAL6Q6IPX3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCEAL6Q6IPX3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCEAL6Q6IPX3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCEAL6Q6IPX3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCEAL6Q6IPX3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCEAL6Q6IPX3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCEAL6Q6IPX3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCEAL6Q6IPX3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TCEAL6Q6IPX3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCEAL6Q6IPX3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TCEAL6Q6IPX3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TCEAL6Q6IPX3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCEAL6Q6IPX3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCEAL6Q6IPX3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCEAL6Q6IPX3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCEAL6Q6IPX3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCEAL6Q6IPX3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCEAL6Q6IPX3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCEAL6Q6IPX3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TCEAL6Q6IPX3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCEAL6Q6IPX3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCEAL6Q6IPX3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCEAL6Q6IPX3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCEAL6Q6IPX3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TCEAL6Q6IPX3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCEAL6Q6IPX3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TCEAL6Q6IPX3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCEAL6Q6IPX3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TCEAL6Q6IPX3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCEAL6Q6IPX3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCEAL6Q6IPX3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCEAL6Q6IPX3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCEAL6Q6IPX3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCEAL6Q6IPX3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCEAL6Q6IPX3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCEAL6Q6IPX3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCEAL6Q6IPX3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TCEAL6Q6IPX3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TCEAL6Q6IPX3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCEAL6Q6IPX3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCEAL6Q6IPX3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCEAL6Q6IPX3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCEAL6Q6IPX3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCEAL6Q6IPX3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCEAL6Q6IPX3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TCEAL6Q6IPX3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCEAL6Q6IPX3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCEAL6Q6IPX3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCEAL6Q6IPX3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCEAL6Q6IPX3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCEAL6Q6IPX3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCEAL6Q6IPX3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCEAL6Q6IPX3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCEAL6Q6IPX3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TCEAL6Q6IPX3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCEAL6Q6IPX3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TCEAL6Q6IPX3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCEAL6Q6IPX3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCEAL6Q6IPX3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCEAL6Q6IPX3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCEAL6Q6IPX3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TCEAL6Q6IPX3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TCEAL6Q6IPX3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TCEAL6Q6IPX3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCEAL6Q6IPX3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCEAL6Q6IPX3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCEAL6Q6IPX3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TCEAL6Q6IPX3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TCEAL6Q6IPX3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCEAL6Q6IPX3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms