Protein–RNA interactions for Protein: Q6FI13

HIST2H2AA3, Histone H2A type 2-A, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIST2H2AA3Q6FI13 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIST2H2AA3Q6FI13 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HIST2H2AA3Q6FI13 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HIST2H2AA3Q6FI13 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIST2H2AA3Q6FI13 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIST2H2AA3Q6FI13 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIST2H2AA3Q6FI13 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIST2H2AA3Q6FI13 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIST2H2AA3Q6FI13 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIST2H2AA3Q6FI13 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIST2H2AA3Q6FI13 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIST2H2AA3Q6FI13 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIST2H2AA3Q6FI13 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIST2H2AA3Q6FI13 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIST2H2AA3Q6FI13 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIST2H2AA3Q6FI13 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIST2H2AA3Q6FI13 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIST2H2AA3Q6FI13 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HIST2H2AA3Q6FI13 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIST2H2AA3Q6FI13 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIST2H2AA3Q6FI13 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIST2H2AA3Q6FI13 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIST2H2AA3Q6FI13 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIST2H2AA3Q6FI13 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIST2H2AA3Q6FI13 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIST2H2AA3Q6FI13 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIST2H2AA3Q6FI13 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIST2H2AA3Q6FI13 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIST2H2AA3Q6FI13 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIST2H2AA3Q6FI13 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIST2H2AA3Q6FI13 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIST2H2AA3Q6FI13 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HIST2H2AA3Q6FI13 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIST2H2AA3Q6FI13 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIST2H2AA3Q6FI13 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIST2H2AA3Q6FI13 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIST2H2AA3Q6FI13 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HIST2H2AA3Q6FI13 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIST2H2AA3Q6FI13 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIST2H2AA3Q6FI13 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIST2H2AA3Q6FI13 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIST2H2AA3Q6FI13 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIST2H2AA3Q6FI13 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIST2H2AA3Q6FI13 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIST2H2AA3Q6FI13 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIST2H2AA3Q6FI13 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIST2H2AA3Q6FI13 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIST2H2AA3Q6FI13 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIST2H2AA3Q6FI13 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIST2H2AA3Q6FI13 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIST2H2AA3Q6FI13 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIST2H2AA3Q6FI13 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIST2H2AA3Q6FI13 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIST2H2AA3Q6FI13 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIST2H2AA3Q6FI13 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HIST2H2AA3Q6FI13 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIST2H2AA3Q6FI13 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIST2H2AA3Q6FI13 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HIST2H2AA3Q6FI13 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms