Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TNS3Q68CZ2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TNS3Q68CZ2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TNS3Q68CZ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TNS3Q68CZ2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TNS3Q68CZ2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TNS3Q68CZ2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TNS3Q68CZ2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TNS3Q68CZ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TNS3Q68CZ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TNS3Q68CZ2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TNS3Q68CZ2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TNS3Q68CZ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TNS3Q68CZ2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TNS3Q68CZ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
TNS3Q68CZ2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TNS3Q68CZ2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TNS3Q68CZ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TNS3Q68CZ2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TNS3Q68CZ2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TNS3Q68CZ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TNS3Q68CZ2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TNS3Q68CZ2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TNS3Q68CZ2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
TNS3Q68CZ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TNS3Q68CZ2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TNS3Q68CZ2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
TNS3Q68CZ2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TNS3Q68CZ2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TNS3Q68CZ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TNS3Q68CZ2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TNS3Q68CZ2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TNS3Q68CZ2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TNS3Q68CZ2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TNS3Q68CZ2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
TNS3Q68CZ2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TNS3Q68CZ2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TNS3Q68CZ2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TNS3Q68CZ2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TNS3Q68CZ2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
TNS3Q68CZ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TNS3Q68CZ2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TNS3Q68CZ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TNS3Q68CZ2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TNS3Q68CZ2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TNS3Q68CZ2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
TNS3Q68CZ2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
TNS3Q68CZ2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TNS3Q68CZ2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TNS3Q68CZ2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TNS3Q68CZ2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TNS3Q68CZ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TNS3Q68CZ2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TNS3Q68CZ2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TNS3Q68CZ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TNS3Q68CZ2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TNS3Q68CZ2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TNS3Q68CZ2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TNS3Q68CZ2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
TNS3Q68CZ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TNS3Q68CZ2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TNS3Q68CZ2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TNS3Q68CZ2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TNS3Q68CZ2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TNS3Q68CZ2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TNS3Q68CZ2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TNS3Q68CZ2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
TNS3Q68CZ2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
TNS3Q68CZ2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
TNS3Q68CZ2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
TNS3Q68CZ2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
TNS3Q68CZ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TNS3Q68CZ2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TNS3Q68CZ2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TNS3Q68CZ2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TNS3Q68CZ2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TNS3Q68CZ2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TNS3Q68CZ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TNS3Q68CZ2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TNS3Q68CZ2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TNS3Q68CZ2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
TNS3Q68CZ2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TNS3Q68CZ2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
TNS3Q68CZ2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TNS3Q68CZ2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TNS3Q68CZ2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TNS3Q68CZ2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TNS3Q68CZ2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TNS3Q68CZ2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TNS3Q68CZ2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TNS3Q68CZ2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TNS3Q68CZ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TNS3Q68CZ2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TNS3Q68CZ2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TNS3Q68CZ2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
TNS3Q68CZ2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TNS3Q68CZ2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TNS3Q68CZ2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TNS3Q68CZ2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TNS3Q68CZ2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms