Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2CLQ60I27 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALS2CLQ60I27 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2CLQ60I27 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2CLQ60I27 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2CLQ60I27 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALS2CLQ60I27 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALS2CLQ60I27 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2CLQ60I27 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2CLQ60I27 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2CLQ60I27 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2CLQ60I27 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ALS2CLQ60I27 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALS2CLQ60I27 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2CLQ60I27 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALS2CLQ60I27 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALS2CLQ60I27 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALS2CLQ60I27 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2CLQ60I27 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALS2CLQ60I27 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2CLQ60I27 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2CLQ60I27 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2CLQ60I27 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALS2CLQ60I27 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALS2CLQ60I27 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2CLQ60I27 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2CLQ60I27 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2CLQ60I27 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALS2CLQ60I27 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALS2CLQ60I27 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALS2CLQ60I27 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALS2CLQ60I27 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALS2CLQ60I27 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALS2CLQ60I27 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALS2CLQ60I27 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALS2CLQ60I27 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALS2CLQ60I27 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALS2CLQ60I27 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2CLQ60I27 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2CLQ60I27 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2CLQ60I27 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2CLQ60I27 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2CLQ60I27 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2CLQ60I27 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALS2CLQ60I27 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2CLQ60I27 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2CLQ60I27 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2CLQ60I27 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2CLQ60I27 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2CLQ60I27 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2CLQ60I27 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2CLQ60I27 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2CLQ60I27 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2CLQ60I27 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2CLQ60I27 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2CLQ60I27 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2CLQ60I27 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2CLQ60I27 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2CLQ60I27 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALS2CLQ60I27 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALS2CLQ60I27 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALS2CLQ60I27 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2CLQ60I27 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2CLQ60I27 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALS2CLQ60I27 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALS2CLQ60I27 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ALS2CLQ60I27 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALS2CLQ60I27 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALS2CLQ60I27 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALS2CLQ60I27 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALS2CLQ60I27 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2CLQ60I27 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALS2CLQ60I27 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALS2CLQ60I27 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALS2CLQ60I27 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALS2CLQ60I27 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALS2CLQ60I27 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2CLQ60I27 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2CLQ60I27 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2CLQ60I27 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2CLQ60I27 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2CLQ60I27 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2CLQ60I27 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2CLQ60I27 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALS2CLQ60I27 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALS2CLQ60I27 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALS2CLQ60I27 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALS2CLQ60I27 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALS2CLQ60I27 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALS2CLQ60I27 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALS2CLQ60I27 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALS2CLQ60I27 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALS2CLQ60I27 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALS2CLQ60I27 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALS2CLQ60I27 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALS2CLQ60I27 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
ALS2CLQ60I27 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALS2CLQ60I27 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALS2CLQ60I27 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALS2CLQ60I27 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms