Protein–RNA interactions for Protein: Q5TEA6

SEL1L2, Protein sel-1 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEL1L2Q5TEA6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEL1L2Q5TEA6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEL1L2Q5TEA6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEL1L2Q5TEA6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEL1L2Q5TEA6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEL1L2Q5TEA6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEL1L2Q5TEA6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEL1L2Q5TEA6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEL1L2Q5TEA6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEL1L2Q5TEA6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEL1L2Q5TEA6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEL1L2Q5TEA6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEL1L2Q5TEA6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEL1L2Q5TEA6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEL1L2Q5TEA6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEL1L2Q5TEA6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEL1L2Q5TEA6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEL1L2Q5TEA6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEL1L2Q5TEA6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEL1L2Q5TEA6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEL1L2Q5TEA6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEL1L2Q5TEA6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SEL1L2Q5TEA6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEL1L2Q5TEA6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEL1L2Q5TEA6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEL1L2Q5TEA6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEL1L2Q5TEA6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEL1L2Q5TEA6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEL1L2Q5TEA6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEL1L2Q5TEA6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEL1L2Q5TEA6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SEL1L2Q5TEA6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEL1L2Q5TEA6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEL1L2Q5TEA6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEL1L2Q5TEA6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEL1L2Q5TEA6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEL1L2Q5TEA6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEL1L2Q5TEA6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEL1L2Q5TEA6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEL1L2Q5TEA6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SEL1L2Q5TEA6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SEL1L2Q5TEA6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEL1L2Q5TEA6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEL1L2Q5TEA6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEL1L2Q5TEA6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEL1L2Q5TEA6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEL1L2Q5TEA6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEL1L2Q5TEA6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEL1L2Q5TEA6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SEL1L2Q5TEA6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEL1L2Q5TEA6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEL1L2Q5TEA6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEL1L2Q5TEA6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEL1L2Q5TEA6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEL1L2Q5TEA6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEL1L2Q5TEA6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEL1L2Q5TEA6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEL1L2Q5TEA6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEL1L2Q5TEA6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SEL1L2Q5TEA6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEL1L2Q5TEA6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEL1L2Q5TEA6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEL1L2Q5TEA6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEL1L2Q5TEA6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEL1L2Q5TEA6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEL1L2Q5TEA6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEL1L2Q5TEA6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEL1L2Q5TEA6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SEL1L2Q5TEA6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEL1L2Q5TEA6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEL1L2Q5TEA6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEL1L2Q5TEA6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SEL1L2Q5TEA6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEL1L2Q5TEA6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEL1L2Q5TEA6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEL1L2Q5TEA6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEL1L2Q5TEA6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEL1L2Q5TEA6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEL1L2Q5TEA6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEL1L2Q5TEA6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEL1L2Q5TEA6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEL1L2Q5TEA6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms