Protein–RNA interactions for Protein: Q5T160

RARS2, Probable arginine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARS2Q5T160 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RARS2Q5T160 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RARS2Q5T160 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RARS2Q5T160 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RARS2Q5T160 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RARS2Q5T160 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RARS2Q5T160 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RARS2Q5T160 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RARS2Q5T160 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RARS2Q5T160 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RARS2Q5T160 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RARS2Q5T160 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RARS2Q5T160 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RARS2Q5T160 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARS2Q5T160 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARS2Q5T160 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RARS2Q5T160 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RARS2Q5T160 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RARS2Q5T160 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RARS2Q5T160 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RARS2Q5T160 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RARS2Q5T160 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RARS2Q5T160 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RARS2Q5T160 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RARS2Q5T160 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RARS2Q5T160 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RARS2Q5T160 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RARS2Q5T160 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RARS2Q5T160 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RARS2Q5T160 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RARS2Q5T160 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RARS2Q5T160 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RARS2Q5T160 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RARS2Q5T160 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RARS2Q5T160 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RARS2Q5T160 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RARS2Q5T160 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RARS2Q5T160 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RARS2Q5T160 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RARS2Q5T160 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RARS2Q5T160 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RARS2Q5T160 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RARS2Q5T160 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RARS2Q5T160 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RARS2Q5T160 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RARS2Q5T160 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RARS2Q5T160 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RARS2Q5T160 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RARS2Q5T160 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RARS2Q5T160 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RARS2Q5T160 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RARS2Q5T160 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RARS2Q5T160 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RARS2Q5T160 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARS2Q5T160 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARS2Q5T160 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARS2Q5T160 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RARS2Q5T160 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RARS2Q5T160 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARS2Q5T160 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARS2Q5T160 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARS2Q5T160 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARS2Q5T160 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARS2Q5T160 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RARS2Q5T160 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RARS2Q5T160 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RARS2Q5T160 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RARS2Q5T160 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARS2Q5T160 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARS2Q5T160 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARS2Q5T160 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARS2Q5T160 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RARS2Q5T160 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RARS2Q5T160 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARS2Q5T160 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARS2Q5T160 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARS2Q5T160 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARS2Q5T160 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARS2Q5T160 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARS2Q5T160 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARS2Q5T160 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RARS2Q5T160 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARS2Q5T160 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARS2Q5T160 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RARS2Q5T160 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARS2Q5T160 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARS2Q5T160 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARS2Q5T160 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARS2Q5T160 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RARS2Q5T160 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RARS2Q5T160 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RARS2Q5T160 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARS2Q5T160 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARS2Q5T160 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARS2Q5T160 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARS2Q5T160 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARS2Q5T160 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARS2Q5T160 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARS2Q5T160 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARS2Q5T160 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms