Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH2D4BQ5SQS7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH2D4BQ5SQS7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH2D4BQ5SQS7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH2D4BQ5SQS7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH2D4BQ5SQS7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH2D4BQ5SQS7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH2D4BQ5SQS7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH2D4BQ5SQS7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH2D4BQ5SQS7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH2D4BQ5SQS7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH2D4BQ5SQS7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH2D4BQ5SQS7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH2D4BQ5SQS7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH2D4BQ5SQS7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH2D4BQ5SQS7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH2D4BQ5SQS7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH2D4BQ5SQS7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH2D4BQ5SQS7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH2D4BQ5SQS7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH2D4BQ5SQS7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH2D4BQ5SQS7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH2D4BQ5SQS7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH2D4BQ5SQS7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH2D4BQ5SQS7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH2D4BQ5SQS7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH2D4BQ5SQS7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2D4BQ5SQS7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2D4BQ5SQS7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2D4BQ5SQS7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH2D4BQ5SQS7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SH2D4BQ5SQS7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SH2D4BQ5SQS7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH2D4BQ5SQS7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH2D4BQ5SQS7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH2D4BQ5SQS7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH2D4BQ5SQS7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH2D4BQ5SQS7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH2D4BQ5SQS7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH2D4BQ5SQS7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2D4BQ5SQS7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH2D4BQ5SQS7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2D4BQ5SQS7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH2D4BQ5SQS7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH2D4BQ5SQS7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH2D4BQ5SQS7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH2D4BQ5SQS7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2D4BQ5SQS7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2D4BQ5SQS7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SH2D4BQ5SQS7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH2D4BQ5SQS7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SH2D4BQ5SQS7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH2D4BQ5SQS7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH2D4BQ5SQS7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH2D4BQ5SQS7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH2D4BQ5SQS7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2D4BQ5SQS7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2D4BQ5SQS7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2D4BQ5SQS7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH2D4BQ5SQS7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH2D4BQ5SQS7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH2D4BQ5SQS7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH2D4BQ5SQS7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH2D4BQ5SQS7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH2D4BQ5SQS7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH2D4BQ5SQS7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH2D4BQ5SQS7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH2D4BQ5SQS7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH2D4BQ5SQS7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH2D4BQ5SQS7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH2D4BQ5SQS7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH2D4BQ5SQS7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH2D4BQ5SQS7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH2D4BQ5SQS7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH2D4BQ5SQS7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH2D4BQ5SQS7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH2D4BQ5SQS7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH2D4BQ5SQS7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH2D4BQ5SQS7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SH2D4BQ5SQS7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH2D4BQ5SQS7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH2D4BQ5SQS7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH2D4BQ5SQS7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH2D4BQ5SQS7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH2D4BQ5SQS7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH2D4BQ5SQS7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SH2D4BQ5SQS7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH2D4BQ5SQS7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH2D4BQ5SQS7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH2D4BQ5SQS7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH2D4BQ5SQS7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH2D4BQ5SQS7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH2D4BQ5SQS7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SH2D4BQ5SQS7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH2D4BQ5SQS7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH2D4BQ5SQS7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SH2D4BQ5SQS7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH2D4BQ5SQS7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH2D4BQ5SQS7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH2D4BQ5SQS7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms