Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATAT1Q5SQI0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATAT1Q5SQI0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATAT1Q5SQI0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATAT1Q5SQI0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATAT1Q5SQI0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ATAT1Q5SQI0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATAT1Q5SQI0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATAT1Q5SQI0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATAT1Q5SQI0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATAT1Q5SQI0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATAT1Q5SQI0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATAT1Q5SQI0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATAT1Q5SQI0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATAT1Q5SQI0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATAT1Q5SQI0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATAT1Q5SQI0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATAT1Q5SQI0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATAT1Q5SQI0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATAT1Q5SQI0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATAT1Q5SQI0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATAT1Q5SQI0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATAT1Q5SQI0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATAT1Q5SQI0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATAT1Q5SQI0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATAT1Q5SQI0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATAT1Q5SQI0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATAT1Q5SQI0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATAT1Q5SQI0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATAT1Q5SQI0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATAT1Q5SQI0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATAT1Q5SQI0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ATAT1Q5SQI0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATAT1Q5SQI0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATAT1Q5SQI0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATAT1Q5SQI0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATAT1Q5SQI0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATAT1Q5SQI0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATAT1Q5SQI0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATAT1Q5SQI0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATAT1Q5SQI0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATAT1Q5SQI0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATAT1Q5SQI0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATAT1Q5SQI0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATAT1Q5SQI0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATAT1Q5SQI0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATAT1Q5SQI0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATAT1Q5SQI0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATAT1Q5SQI0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATAT1Q5SQI0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATAT1Q5SQI0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATAT1Q5SQI0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATAT1Q5SQI0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATAT1Q5SQI0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATAT1Q5SQI0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAT1Q5SQI0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATAT1Q5SQI0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATAT1Q5SQI0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATAT1Q5SQI0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATAT1Q5SQI0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATAT1Q5SQI0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATAT1Q5SQI0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATAT1Q5SQI0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATAT1Q5SQI0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATAT1Q5SQI0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAT1Q5SQI0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAT1Q5SQI0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATAT1Q5SQI0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATAT1Q5SQI0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATAT1Q5SQI0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATAT1Q5SQI0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAT1Q5SQI0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAT1Q5SQI0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAT1Q5SQI0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAT1Q5SQI0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATAT1Q5SQI0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATAT1Q5SQI0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATAT1Q5SQI0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATAT1Q5SQI0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATAT1Q5SQI0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATAT1Q5SQI0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATAT1Q5SQI0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATAT1Q5SQI0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATAT1Q5SQI0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATAT1Q5SQI0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATAT1Q5SQI0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATAT1Q5SQI0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ATAT1Q5SQI0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ATAT1Q5SQI0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATAT1Q5SQI0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATAT1Q5SQI0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATAT1Q5SQI0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATAT1Q5SQI0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATAT1Q5SQI0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ATAT1Q5SQI0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ATAT1Q5SQI0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATAT1Q5SQI0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATAT1Q5SQI0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATAT1Q5SQI0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATAT1Q5SQI0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms