Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDK2Q58EX2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDK2Q58EX2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDK2Q58EX2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDK2Q58EX2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDK2Q58EX2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SDK2Q58EX2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SDK2Q58EX2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDK2Q58EX2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDK2Q58EX2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDK2Q58EX2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDK2Q58EX2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDK2Q58EX2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDK2Q58EX2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDK2Q58EX2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDK2Q58EX2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDK2Q58EX2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDK2Q58EX2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDK2Q58EX2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SDK2Q58EX2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDK2Q58EX2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDK2Q58EX2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDK2Q58EX2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDK2Q58EX2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDK2Q58EX2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDK2Q58EX2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDK2Q58EX2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDK2Q58EX2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDK2Q58EX2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDK2Q58EX2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDK2Q58EX2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDK2Q58EX2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDK2Q58EX2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDK2Q58EX2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDK2Q58EX2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDK2Q58EX2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDK2Q58EX2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDK2Q58EX2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDK2Q58EX2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SDK2Q58EX2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDK2Q58EX2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDK2Q58EX2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDK2Q58EX2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDK2Q58EX2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDK2Q58EX2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDK2Q58EX2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDK2Q58EX2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDK2Q58EX2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDK2Q58EX2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDK2Q58EX2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDK2Q58EX2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDK2Q58EX2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDK2Q58EX2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDK2Q58EX2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDK2Q58EX2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDK2Q58EX2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDK2Q58EX2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDK2Q58EX2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDK2Q58EX2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDK2Q58EX2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDK2Q58EX2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDK2Q58EX2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDK2Q58EX2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDK2Q58EX2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDK2Q58EX2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDK2Q58EX2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SDK2Q58EX2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDK2Q58EX2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDK2Q58EX2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDK2Q58EX2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDK2Q58EX2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDK2Q58EX2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDK2Q58EX2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDK2Q58EX2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDK2Q58EX2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDK2Q58EX2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDK2Q58EX2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDK2Q58EX2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDK2Q58EX2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDK2Q58EX2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDK2Q58EX2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDK2Q58EX2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SDK2Q58EX2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms