Protein–RNA interactions for Protein: Q53TN4

CYBRD1, Cytochrome b reductase 1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBRD1Q53TN4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYBRD1Q53TN4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYBRD1Q53TN4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYBRD1Q53TN4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYBRD1Q53TN4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYBRD1Q53TN4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYBRD1Q53TN4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYBRD1Q53TN4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CYBRD1Q53TN4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYBRD1Q53TN4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYBRD1Q53TN4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYBRD1Q53TN4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYBRD1Q53TN4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYBRD1Q53TN4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYBRD1Q53TN4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYBRD1Q53TN4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYBRD1Q53TN4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYBRD1Q53TN4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYBRD1Q53TN4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYBRD1Q53TN4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYBRD1Q53TN4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYBRD1Q53TN4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYBRD1Q53TN4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CYBRD1Q53TN4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYBRD1Q53TN4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYBRD1Q53TN4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYBRD1Q53TN4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYBRD1Q53TN4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYBRD1Q53TN4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYBRD1Q53TN4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYBRD1Q53TN4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYBRD1Q53TN4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYBRD1Q53TN4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYBRD1Q53TN4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYBRD1Q53TN4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYBRD1Q53TN4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYBRD1Q53TN4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYBRD1Q53TN4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYBRD1Q53TN4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYBRD1Q53TN4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYBRD1Q53TN4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYBRD1Q53TN4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYBRD1Q53TN4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYBRD1Q53TN4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYBRD1Q53TN4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYBRD1Q53TN4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYBRD1Q53TN4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYBRD1Q53TN4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYBRD1Q53TN4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYBRD1Q53TN4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYBRD1Q53TN4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYBRD1Q53TN4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYBRD1Q53TN4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYBRD1Q53TN4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CYBRD1Q53TN4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYBRD1Q53TN4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYBRD1Q53TN4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYBRD1Q53TN4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYBRD1Q53TN4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYBRD1Q53TN4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYBRD1Q53TN4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYBRD1Q53TN4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYBRD1Q53TN4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYBRD1Q53TN4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYBRD1Q53TN4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYBRD1Q53TN4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYBRD1Q53TN4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYBRD1Q53TN4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYBRD1Q53TN4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYBRD1Q53TN4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYBRD1Q53TN4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYBRD1Q53TN4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYBRD1Q53TN4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYBRD1Q53TN4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYBRD1Q53TN4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYBRD1Q53TN4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYBRD1Q53TN4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYBRD1Q53TN4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYBRD1Q53TN4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYBRD1Q53TN4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYBRD1Q53TN4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYBRD1Q53TN4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYBRD1Q53TN4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYBRD1Q53TN4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYBRD1Q53TN4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYBRD1Q53TN4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYBRD1Q53TN4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CYBRD1Q53TN4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYBRD1Q53TN4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYBRD1Q53TN4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CYBRD1Q53TN4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYBRD1Q53TN4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYBRD1Q53TN4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYBRD1Q53TN4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYBRD1Q53TN4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYBRD1Q53TN4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYBRD1Q53TN4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYBRD1Q53TN4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYBRD1Q53TN4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYBRD1Q53TN4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms