Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TPRNQ4KMQ1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TPRNQ4KMQ1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TPRNQ4KMQ1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TPRNQ4KMQ1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TPRNQ4KMQ1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TPRNQ4KMQ1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TPRNQ4KMQ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TPRNQ4KMQ1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TPRNQ4KMQ1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
TPRNQ4KMQ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TPRNQ4KMQ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TPRNQ4KMQ1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TPRNQ4KMQ1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TPRNQ4KMQ1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
TPRNQ4KMQ1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TPRNQ4KMQ1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TPRNQ4KMQ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TPRNQ4KMQ1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TPRNQ4KMQ1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TPRNQ4KMQ1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TPRNQ4KMQ1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TPRNQ4KMQ1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TPRNQ4KMQ1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TPRNQ4KMQ1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TPRNQ4KMQ1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TPRNQ4KMQ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TPRNQ4KMQ1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TPRNQ4KMQ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TPRNQ4KMQ1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TPRNQ4KMQ1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
TPRNQ4KMQ1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TPRNQ4KMQ1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TPRNQ4KMQ1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TPRNQ4KMQ1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TPRNQ4KMQ1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TPRNQ4KMQ1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TPRNQ4KMQ1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TPRNQ4KMQ1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TPRNQ4KMQ1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TPRNQ4KMQ1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TPRNQ4KMQ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TPRNQ4KMQ1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TPRNQ4KMQ1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TPRNQ4KMQ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TPRNQ4KMQ1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TPRNQ4KMQ1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TPRNQ4KMQ1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TPRNQ4KMQ1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TPRNQ4KMQ1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TPRNQ4KMQ1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TPRNQ4KMQ1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TPRNQ4KMQ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TPRNQ4KMQ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TPRNQ4KMQ1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
TPRNQ4KMQ1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TPRNQ4KMQ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TPRNQ4KMQ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TPRNQ4KMQ1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TPRNQ4KMQ1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TPRNQ4KMQ1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
TPRNQ4KMQ1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TPRNQ4KMQ1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TPRNQ4KMQ1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TPRNQ4KMQ1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TPRNQ4KMQ1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TPRNQ4KMQ1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TPRNQ4KMQ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TPRNQ4KMQ1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TPRNQ4KMQ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TPRNQ4KMQ1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TPRNQ4KMQ1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TPRNQ4KMQ1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TPRNQ4KMQ1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TPRNQ4KMQ1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TPRNQ4KMQ1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TPRNQ4KMQ1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TPRNQ4KMQ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TPRNQ4KMQ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TPRNQ4KMQ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TPRNQ4KMQ1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TPRNQ4KMQ1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TPRNQ4KMQ1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TPRNQ4KMQ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TPRNQ4KMQ1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TPRNQ4KMQ1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TPRNQ4KMQ1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TPRNQ4KMQ1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TPRNQ4KMQ1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TPRNQ4KMQ1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TPRNQ4KMQ1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TPRNQ4KMQ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TPRNQ4KMQ1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TPRNQ4KMQ1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TPRNQ4KMQ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TPRNQ4KMQ1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TPRNQ4KMQ1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TPRNQ4KMQ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TPRNQ4KMQ1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TPRNQ4KMQ1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
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