Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9K0

TMEM44, Transmembrane protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM44Q2T9K0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM44Q2T9K0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM44Q2T9K0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM44Q2T9K0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM44Q2T9K0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM44Q2T9K0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM44Q2T9K0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM44Q2T9K0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM44Q2T9K0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM44Q2T9K0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM44Q2T9K0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM44Q2T9K0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM44Q2T9K0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM44Q2T9K0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM44Q2T9K0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM44Q2T9K0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM44Q2T9K0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM44Q2T9K0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM44Q2T9K0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM44Q2T9K0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM44Q2T9K0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM44Q2T9K0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM44Q2T9K0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM44Q2T9K0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM44Q2T9K0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM44Q2T9K0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM44Q2T9K0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM44Q2T9K0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM44Q2T9K0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM44Q2T9K0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM44Q2T9K0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM44Q2T9K0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM44Q2T9K0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM44Q2T9K0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM44Q2T9K0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM44Q2T9K0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM44Q2T9K0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM44Q2T9K0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM44Q2T9K0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM44Q2T9K0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM44Q2T9K0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM44Q2T9K0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM44Q2T9K0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM44Q2T9K0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM44Q2T9K0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM44Q2T9K0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM44Q2T9K0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM44Q2T9K0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM44Q2T9K0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM44Q2T9K0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM44Q2T9K0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM44Q2T9K0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM44Q2T9K0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM44Q2T9K0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM44Q2T9K0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM44Q2T9K0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM44Q2T9K0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM44Q2T9K0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM44Q2T9K0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM44Q2T9K0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM44Q2T9K0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM44Q2T9K0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM44Q2T9K0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM44Q2T9K0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM44Q2T9K0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms