Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LONRF2Q1L5Z9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LONRF2Q1L5Z9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LONRF2Q1L5Z9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LONRF2Q1L5Z9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LONRF2Q1L5Z9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LONRF2Q1L5Z9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LONRF2Q1L5Z9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LONRF2Q1L5Z9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LONRF2Q1L5Z9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LONRF2Q1L5Z9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LONRF2Q1L5Z9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LONRF2Q1L5Z9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LONRF2Q1L5Z9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LONRF2Q1L5Z9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LONRF2Q1L5Z9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LONRF2Q1L5Z9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LONRF2Q1L5Z9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LONRF2Q1L5Z9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LONRF2Q1L5Z9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LONRF2Q1L5Z9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LONRF2Q1L5Z9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LONRF2Q1L5Z9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LONRF2Q1L5Z9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LONRF2Q1L5Z9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LONRF2Q1L5Z9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LONRF2Q1L5Z9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LONRF2Q1L5Z9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LONRF2Q1L5Z9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LONRF2Q1L5Z9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LONRF2Q1L5Z9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LONRF2Q1L5Z9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LONRF2Q1L5Z9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LONRF2Q1L5Z9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LONRF2Q1L5Z9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LONRF2Q1L5Z9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LONRF2Q1L5Z9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LONRF2Q1L5Z9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LONRF2Q1L5Z9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LONRF2Q1L5Z9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LONRF2Q1L5Z9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LONRF2Q1L5Z9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LONRF2Q1L5Z9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LONRF2Q1L5Z9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LONRF2Q1L5Z9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LONRF2Q1L5Z9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LONRF2Q1L5Z9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LONRF2Q1L5Z9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LONRF2Q1L5Z9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LONRF2Q1L5Z9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LONRF2Q1L5Z9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LONRF2Q1L5Z9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LONRF2Q1L5Z9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LONRF2Q1L5Z9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LONRF2Q1L5Z9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LONRF2Q1L5Z9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LONRF2Q1L5Z9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LONRF2Q1L5Z9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LONRF2Q1L5Z9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LONRF2Q1L5Z9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LONRF2Q1L5Z9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LONRF2Q1L5Z9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LONRF2Q1L5Z9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LONRF2Q1L5Z9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LONRF2Q1L5Z9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LONRF2Q1L5Z9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LONRF2Q1L5Z9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LONRF2Q1L5Z9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LONRF2Q1L5Z9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LONRF2Q1L5Z9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LONRF2Q1L5Z9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LONRF2Q1L5Z9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LONRF2Q1L5Z9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF2Q1L5Z9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF2Q1L5Z9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF2Q1L5Z9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF2Q1L5Z9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LONRF2Q1L5Z9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LONRF2Q1L5Z9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LONRF2Q1L5Z9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LONRF2Q1L5Z9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LONRF2Q1L5Z9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LONRF2Q1L5Z9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LONRF2Q1L5Z9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LONRF2Q1L5Z9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LONRF2Q1L5Z9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LONRF2Q1L5Z9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LONRF2Q1L5Z9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LONRF2Q1L5Z9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LONRF2Q1L5Z9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LONRF2Q1L5Z9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LONRF2Q1L5Z9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LONRF2Q1L5Z9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LONRF2Q1L5Z9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LONRF2Q1L5Z9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LONRF2Q1L5Z9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LONRF2Q1L5Z9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LONRF2Q1L5Z9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LONRF2Q1L5Z9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LONRF2Q1L5Z9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms