Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LONRF1Q17RB8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LONRF1Q17RB8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LONRF1Q17RB8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LONRF1Q17RB8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LONRF1Q17RB8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LONRF1Q17RB8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LONRF1Q17RB8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LONRF1Q17RB8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LONRF1Q17RB8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LONRF1Q17RB8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LONRF1Q17RB8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LONRF1Q17RB8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LONRF1Q17RB8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LONRF1Q17RB8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LONRF1Q17RB8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LONRF1Q17RB8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LONRF1Q17RB8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LONRF1Q17RB8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONRF1Q17RB8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LONRF1Q17RB8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LONRF1Q17RB8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF1Q17RB8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONRF1Q17RB8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONRF1Q17RB8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LONRF1Q17RB8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LONRF1Q17RB8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LONRF1Q17RB8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LONRF1Q17RB8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LONRF1Q17RB8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LONRF1Q17RB8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LONRF1Q17RB8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LONRF1Q17RB8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LONRF1Q17RB8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LONRF1Q17RB8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LONRF1Q17RB8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LONRF1Q17RB8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LONRF1Q17RB8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LONRF1Q17RB8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONRF1Q17RB8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONRF1Q17RB8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONRF1Q17RB8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LONRF1Q17RB8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LONRF1Q17RB8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LONRF1Q17RB8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LONRF1Q17RB8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LONRF1Q17RB8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LONRF1Q17RB8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LONRF1Q17RB8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LONRF1Q17RB8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LONRF1Q17RB8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LONRF1Q17RB8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LONRF1Q17RB8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LONRF1Q17RB8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LONRF1Q17RB8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LONRF1Q17RB8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LONRF1Q17RB8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LONRF1Q17RB8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LONRF1Q17RB8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LONRF1Q17RB8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LONRF1Q17RB8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LONRF1Q17RB8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LONRF1Q17RB8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LONRF1Q17RB8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LONRF1Q17RB8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LONRF1Q17RB8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LONRF1Q17RB8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LONRF1Q17RB8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LONRF1Q17RB8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LONRF1Q17RB8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LONRF1Q17RB8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LONRF1Q17RB8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LONRF1Q17RB8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LONRF1Q17RB8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LONRF1Q17RB8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LONRF1Q17RB8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LONRF1Q17RB8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LONRF1Q17RB8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LONRF1Q17RB8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LONRF1Q17RB8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LONRF1Q17RB8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LONRF1Q17RB8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LONRF1Q17RB8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LONRF1Q17RB8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LONRF1Q17RB8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LONRF1Q17RB8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LONRF1Q17RB8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LONRF1Q17RB8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LONRF1Q17RB8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LONRF1Q17RB8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LONRF1Q17RB8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LONRF1Q17RB8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LONRF1Q17RB8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LONRF1Q17RB8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LONRF1Q17RB8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LONRF1Q17RB8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LONRF1Q17RB8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LONRF1Q17RB8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LONRF1Q17RB8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LONRF1Q17RB8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
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