Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP6V1FQ16864 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6V1FQ16864 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6V1FQ16864 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6V1FQ16864 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6V1FQ16864 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6V1FQ16864 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6V1FQ16864 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP6V1FQ16864 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP6V1FQ16864 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP6V1FQ16864 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP6V1FQ16864 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
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